Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lhfpl3Q9CTN8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lhfpl3Q9CTN8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lhfpl3Q9CTN8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Lhfpl3Q9CTN8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lhfpl3Q9CTN8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lhfpl3Q9CTN8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lhfpl3Q9CTN8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Lhfpl3Q9CTN8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lhfpl3Q9CTN8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lhfpl3Q9CTN8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lhfpl3Q9CTN8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lhfpl3Q9CTN8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lhfpl3Q9CTN8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lhfpl3Q9CTN8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lhfpl3Q9CTN8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lhfpl3Q9CTN8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lhfpl3Q9CTN8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lhfpl3Q9CTN8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lhfpl3Q9CTN8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lhfpl3Q9CTN8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lhfpl3Q9CTN8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lhfpl3Q9CTN8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lhfpl3Q9CTN8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lhfpl3Q9CTN8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lhfpl3Q9CTN8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lhfpl3Q9CTN8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lhfpl3Q9CTN8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lhfpl3Q9CTN8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Lhfpl3Q9CTN8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lhfpl3Q9CTN8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lhfpl3Q9CTN8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lhfpl3Q9CTN8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lhfpl3Q9CTN8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms