Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS00

Cactin, Cactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CactinQ9CS00 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CactinQ9CS00 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CactinQ9CS00 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CactinQ9CS00 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CactinQ9CS00 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CactinQ9CS00 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CactinQ9CS00 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CactinQ9CS00 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CactinQ9CS00 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CactinQ9CS00 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CactinQ9CS00 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CactinQ9CS00 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CactinQ9CS00 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CactinQ9CS00 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CactinQ9CS00 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CactinQ9CS00 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CactinQ9CS00 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CactinQ9CS00 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CactinQ9CS00 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CactinQ9CS00 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CactinQ9CS00 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CactinQ9CS00 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CactinQ9CS00 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CactinQ9CS00 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CactinQ9CS00 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CactinQ9CS00 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CactinQ9CS00 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CactinQ9CS00 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CactinQ9CS00 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CactinQ9CS00 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CactinQ9CS00 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CactinQ9CS00 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CactinQ9CS00 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CactinQ9CS00 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CactinQ9CS00 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CactinQ9CS00 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CactinQ9CS00 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CactinQ9CS00 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CactinQ9CS00 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CactinQ9CS00 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CactinQ9CS00 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CactinQ9CS00 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CactinQ9CS00 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CactinQ9CS00 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CactinQ9CS00 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CactinQ9CS00 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CactinQ9CS00 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CactinQ9CS00 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CactinQ9CS00 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CactinQ9CS00 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CactinQ9CS00 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CactinQ9CS00 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CactinQ9CS00 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CactinQ9CS00 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CactinQ9CS00 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CactinQ9CS00 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CactinQ9CS00 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CactinQ9CS00 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CactinQ9CS00 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CactinQ9CS00 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CactinQ9CS00 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CactinQ9CS00 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CactinQ9CS00 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CactinQ9CS00 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CactinQ9CS00 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CactinQ9CS00 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CactinQ9CS00 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CactinQ9CS00 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CactinQ9CS00 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CactinQ9CS00 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CactinQ9CS00 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CactinQ9CS00 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CactinQ9CS00 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CactinQ9CS00 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CactinQ9CS00 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CactinQ9CS00 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CactinQ9CS00 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CactinQ9CS00 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CactinQ9CS00 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CactinQ9CS00 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CactinQ9CS00 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CactinQ9CS00 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CactinQ9CS00 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CactinQ9CS00 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CactinQ9CS00 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CactinQ9CS00 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CactinQ9CS00 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CactinQ9CS00 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CactinQ9CS00 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CactinQ9CS00 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CactinQ9CS00 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CactinQ9CS00 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CactinQ9CS00 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CactinQ9CS00 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CactinQ9CS00 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CactinQ9CS00 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CactinQ9CS00 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CactinQ9CS00 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CactinQ9CS00 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CactinQ9CS00 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms