Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nicn1Q9CQM0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nicn1Q9CQM0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nicn1Q9CQM0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nicn1Q9CQM0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nicn1Q9CQM0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nicn1Q9CQM0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nicn1Q9CQM0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nicn1Q9CQM0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nicn1Q9CQM0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nicn1Q9CQM0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nicn1Q9CQM0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nicn1Q9CQM0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nicn1Q9CQM0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nicn1Q9CQM0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nicn1Q9CQM0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nicn1Q9CQM0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nicn1Q9CQM0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nicn1Q9CQM0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nicn1Q9CQM0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nicn1Q9CQM0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nicn1Q9CQM0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nicn1Q9CQM0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nicn1Q9CQM0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nicn1Q9CQM0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nicn1Q9CQM0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nicn1Q9CQM0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nicn1Q9CQM0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nicn1Q9CQM0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nicn1Q9CQM0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nicn1Q9CQM0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nicn1Q9CQM0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nicn1Q9CQM0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nicn1Q9CQM0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nicn1Q9CQM0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nicn1Q9CQM0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nicn1Q9CQM0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nicn1Q9CQM0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nicn1Q9CQM0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nicn1Q9CQM0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nicn1Q9CQM0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nicn1Q9CQM0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nicn1Q9CQM0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nicn1Q9CQM0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nicn1Q9CQM0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nicn1Q9CQM0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nicn1Q9CQM0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nicn1Q9CQM0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nicn1Q9CQM0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nicn1Q9CQM0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nicn1Q9CQM0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nicn1Q9CQM0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nicn1Q9CQM0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nicn1Q9CQM0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nicn1Q9CQM0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nicn1Q9CQM0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nicn1Q9CQM0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nicn1Q9CQM0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nicn1Q9CQM0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nicn1Q9CQM0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nicn1Q9CQM0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nicn1Q9CQM0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nicn1Q9CQM0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nicn1Q9CQM0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nicn1Q9CQM0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nicn1Q9CQM0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nicn1Q9CQM0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nicn1Q9CQM0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nicn1Q9CQM0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nicn1Q9CQM0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nicn1Q9CQM0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nicn1Q9CQM0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nicn1Q9CQM0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nicn1Q9CQM0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nicn1Q9CQM0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nicn1Q9CQM0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nicn1Q9CQM0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nicn1Q9CQM0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nicn1Q9CQM0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nicn1Q9CQM0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nicn1Q9CQM0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nicn1Q9CQM0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nicn1Q9CQM0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nicn1Q9CQM0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nicn1Q9CQM0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nicn1Q9CQM0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nicn1Q9CQM0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nicn1Q9CQM0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nicn1Q9CQM0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nicn1Q9CQM0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nicn1Q9CQM0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nicn1Q9CQM0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nicn1Q9CQM0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nicn1Q9CQM0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nicn1Q9CQM0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nicn1Q9CQM0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nicn1Q9CQM0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nicn1Q9CQM0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nicn1Q9CQM0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nicn1Q9CQM0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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