Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE7

Ergic3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic3Q9CQE7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ergic3Q9CQE7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ergic3Q9CQE7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ergic3Q9CQE7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ergic3Q9CQE7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ergic3Q9CQE7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ergic3Q9CQE7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ergic3Q9CQE7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ergic3Q9CQE7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ergic3Q9CQE7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ergic3Q9CQE7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ergic3Q9CQE7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ergic3Q9CQE7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ergic3Q9CQE7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ergic3Q9CQE7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ergic3Q9CQE7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ergic3Q9CQE7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ergic3Q9CQE7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ergic3Q9CQE7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ergic3Q9CQE7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ergic3Q9CQE7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ergic3Q9CQE7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ergic3Q9CQE7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ergic3Q9CQE7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ergic3Q9CQE7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ergic3Q9CQE7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ergic3Q9CQE7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ergic3Q9CQE7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ergic3Q9CQE7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ergic3Q9CQE7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ergic3Q9CQE7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ergic3Q9CQE7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ergic3Q9CQE7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ergic3Q9CQE7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ergic3Q9CQE7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ergic3Q9CQE7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ergic3Q9CQE7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ergic3Q9CQE7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ergic3Q9CQE7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ergic3Q9CQE7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ergic3Q9CQE7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ergic3Q9CQE7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ergic3Q9CQE7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ergic3Q9CQE7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ergic3Q9CQE7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ergic3Q9CQE7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ergic3Q9CQE7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ergic3Q9CQE7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ergic3Q9CQE7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ergic3Q9CQE7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ergic3Q9CQE7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ergic3Q9CQE7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ergic3Q9CQE7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ergic3Q9CQE7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ergic3Q9CQE7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ergic3Q9CQE7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ergic3Q9CQE7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ergic3Q9CQE7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ergic3Q9CQE7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ergic3Q9CQE7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ergic3Q9CQE7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ergic3Q9CQE7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ergic3Q9CQE7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ergic3Q9CQE7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ergic3Q9CQE7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ergic3Q9CQE7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ergic3Q9CQE7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ergic3Q9CQE7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ergic3Q9CQE7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ergic3Q9CQE7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ergic3Q9CQE7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ergic3Q9CQE7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ergic3Q9CQE7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ergic3Q9CQE7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ergic3Q9CQE7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ergic3Q9CQE7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ergic3Q9CQE7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ergic3Q9CQE7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ergic3Q9CQE7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ergic3Q9CQE7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ergic3Q9CQE7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ergic3Q9CQE7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ergic3Q9CQE7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ergic3Q9CQE7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ergic3Q9CQE7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ergic3Q9CQE7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ergic3Q9CQE7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ergic3Q9CQE7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ergic3Q9CQE7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ergic3Q9CQE7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ergic3Q9CQE7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ergic3Q9CQE7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ergic3Q9CQE7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ergic3Q9CQE7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ergic3Q9CQE7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ergic3Q9CQE7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ergic3Q9CQE7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ergic3Q9CQE7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ergic3Q9CQE7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ergic3Q9CQE7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms