Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ36

Pole4, DNA polymerase epsilon subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole4Q9CQ36 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pole4Q9CQ36 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pole4Q9CQ36 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pole4Q9CQ36 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pole4Q9CQ36 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pole4Q9CQ36 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pole4Q9CQ36 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pole4Q9CQ36 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pole4Q9CQ36 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pole4Q9CQ36 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pole4Q9CQ36 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pole4Q9CQ36 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pole4Q9CQ36 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pole4Q9CQ36 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pole4Q9CQ36 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pole4Q9CQ36 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pole4Q9CQ36 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pole4Q9CQ36 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pole4Q9CQ36 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pole4Q9CQ36 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pole4Q9CQ36 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pole4Q9CQ36 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pole4Q9CQ36 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pole4Q9CQ36 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pole4Q9CQ36 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pole4Q9CQ36 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pole4Q9CQ36 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pole4Q9CQ36 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pole4Q9CQ36 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pole4Q9CQ36 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pole4Q9CQ36 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pole4Q9CQ36 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pole4Q9CQ36 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pole4Q9CQ36 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pole4Q9CQ36 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pole4Q9CQ36 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pole4Q9CQ36 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pole4Q9CQ36 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pole4Q9CQ36 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Pole4Q9CQ36 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pole4Q9CQ36 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pole4Q9CQ36 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pole4Q9CQ36 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pole4Q9CQ36 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pole4Q9CQ36 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pole4Q9CQ36 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pole4Q9CQ36 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pole4Q9CQ36 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pole4Q9CQ36 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pole4Q9CQ36 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pole4Q9CQ36 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pole4Q9CQ36 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pole4Q9CQ36 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pole4Q9CQ36 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pole4Q9CQ36 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pole4Q9CQ36 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pole4Q9CQ36 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pole4Q9CQ36 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pole4Q9CQ36 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pole4Q9CQ36 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pole4Q9CQ36 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pole4Q9CQ36 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pole4Q9CQ36 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pole4Q9CQ36 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pole4Q9CQ36 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pole4Q9CQ36 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pole4Q9CQ36 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pole4Q9CQ36 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pole4Q9CQ36 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pole4Q9CQ36 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pole4Q9CQ36 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pole4Q9CQ36 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pole4Q9CQ36 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pole4Q9CQ36 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pole4Q9CQ36 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pole4Q9CQ36 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pole4Q9CQ36 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pole4Q9CQ36 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pole4Q9CQ36 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pole4Q9CQ36 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pole4Q9CQ36 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pole4Q9CQ36 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pole4Q9CQ36 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pole4Q9CQ36 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pole4Q9CQ36 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pole4Q9CQ36 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pole4Q9CQ36 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pole4Q9CQ36 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pole4Q9CQ36 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pole4Q9CQ36 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pole4Q9CQ36 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pole4Q9CQ36 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pole4Q9CQ36 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pole4Q9CQ36 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pole4Q9CQ36 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Pole4Q9CQ36 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pole4Q9CQ36 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pole4Q9CQ36 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Pole4Q9CQ36 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pole4Q9CQ36 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 201.2 ms