Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Chmp3Q9CQ10 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Chmp3Q9CQ10 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Chmp3Q9CQ10 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Chmp3Q9CQ10 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Chmp3Q9CQ10 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Chmp3Q9CQ10 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Chmp3Q9CQ10 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Chmp3Q9CQ10 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Chmp3Q9CQ10 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Chmp3Q9CQ10 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Chmp3Q9CQ10 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Chmp3Q9CQ10 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Chmp3Q9CQ10 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Chmp3Q9CQ10 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Chmp3Q9CQ10 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Chmp3Q9CQ10 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Chmp3Q9CQ10 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Chmp3Q9CQ10 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Chmp3Q9CQ10 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Chmp3Q9CQ10 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Chmp3Q9CQ10 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Chmp3Q9CQ10 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Chmp3Q9CQ10 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Chmp3Q9CQ10 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Chmp3Q9CQ10 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Chmp3Q9CQ10 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Chmp3Q9CQ10 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Chmp3Q9CQ10 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Chmp3Q9CQ10 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Chmp3Q9CQ10 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Chmp3Q9CQ10 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Chmp3Q9CQ10 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Chmp3Q9CQ10 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Chmp3Q9CQ10 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Chmp3Q9CQ10 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Chmp3Q9CQ10 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Chmp3Q9CQ10 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Chmp3Q9CQ10 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Chmp3Q9CQ10 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Chmp3Q9CQ10 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Chmp3Q9CQ10 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Chmp3Q9CQ10 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Chmp3Q9CQ10 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Chmp3Q9CQ10 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Chmp3Q9CQ10 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Chmp3Q9CQ10 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Chmp3Q9CQ10 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Chmp3Q9CQ10 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Chmp3Q9CQ10 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Chmp3Q9CQ10 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Chmp3Q9CQ10 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Chmp3Q9CQ10 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Chmp3Q9CQ10 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Chmp3Q9CQ10 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Chmp3Q9CQ10 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Chmp3Q9CQ10 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Chmp3Q9CQ10 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Chmp3Q9CQ10 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Chmp3Q9CQ10 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Chmp3Q9CQ10 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Chmp3Q9CQ10 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Chmp3Q9CQ10 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Chmp3Q9CQ10 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Chmp3Q9CQ10 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Chmp3Q9CQ10 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Chmp3Q9CQ10 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Chmp3Q9CQ10 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Chmp3Q9CQ10 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Chmp3Q9CQ10 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Chmp3Q9CQ10 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Chmp3Q9CQ10 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Chmp3Q9CQ10 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Chmp3Q9CQ10 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Chmp3Q9CQ10 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Chmp3Q9CQ10 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Chmp3Q9CQ10 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Chmp3Q9CQ10 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Chmp3Q9CQ10 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Chmp3Q9CQ10 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Chmp3Q9CQ10 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Chmp3Q9CQ10 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Chmp3Q9CQ10 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Chmp3Q9CQ10 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Chmp3Q9CQ10 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Chmp3Q9CQ10 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Chmp3Q9CQ10 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Chmp3Q9CQ10 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Chmp3Q9CQ10 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Chmp3Q9CQ10 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Chmp3Q9CQ10 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Chmp3Q9CQ10 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Chmp3Q9CQ10 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Chmp3Q9CQ10 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Chmp3Q9CQ10 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Chmp3Q9CQ10 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Chmp3Q9CQ10 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Chmp3Q9CQ10 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Chmp3Q9CQ10 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Chmp3Q9CQ10 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
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