Protein–RNA interactions for Protein: Q99PU8

Dhx30, Putative ATP-dependent RNA helicase DHX30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dhx30Q99PU8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Dhx30Q99PU8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Dhx30Q99PU8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Dhx30Q99PU8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Dhx30Q99PU8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Dhx30Q99PU8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Dhx30Q99PU8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Dhx30Q99PU8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Dhx30Q99PU8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Dhx30Q99PU8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Dhx30Q99PU8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Dhx30Q99PU8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Dhx30Q99PU8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Dhx30Q99PU8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Dhx30Q99PU8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Dhx30Q99PU8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Dhx30Q99PU8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Dhx30Q99PU8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Dhx30Q99PU8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Dhx30Q99PU8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Dhx30Q99PU8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Dhx30Q99PU8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Dhx30Q99PU8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Dhx30Q99PU8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Dhx30Q99PU8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Dhx30Q99PU8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Dhx30Q99PU8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Dhx30Q99PU8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Dhx30Q99PU8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Dhx30Q99PU8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Dhx30Q99PU8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Dhx30Q99PU8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Dhx30Q99PU8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Dhx30Q99PU8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Dhx30Q99PU8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Dhx30Q99PU8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Dhx30Q99PU8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Dhx30Q99PU8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Dhx30Q99PU8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Dhx30Q99PU8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Dhx30Q99PU8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Dhx30Q99PU8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Dhx30Q99PU8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Dhx30Q99PU8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Dhx30Q99PU8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Dhx30Q99PU8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Dhx30Q99PU8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Dhx30Q99PU8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Dhx30Q99PU8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Dhx30Q99PU8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Dhx30Q99PU8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Dhx30Q99PU8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Dhx30Q99PU8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Dhx30Q99PU8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Dhx30Q99PU8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Dhx30Q99PU8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Dhx30Q99PU8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Dhx30Q99PU8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Dhx30Q99PU8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Dhx30Q99PU8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Dhx30Q99PU8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Dhx30Q99PU8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Dhx30Q99PU8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Dhx30Q99PU8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Dhx30Q99PU8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Dhx30Q99PU8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Dhx30Q99PU8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Dhx30Q99PU8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Dhx30Q99PU8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Dhx30Q99PU8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Dhx30Q99PU8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Dhx30Q99PU8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Dhx30Q99PU8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Dhx30Q99PU8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Dhx30Q99PU8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Dhx30Q99PU8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Dhx30Q99PU8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Dhx30Q99PU8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Dhx30Q99PU8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Dhx30Q99PU8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Dhx30Q99PU8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Dhx30Q99PU8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Dhx30Q99PU8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Dhx30Q99PU8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Dhx30Q99PU8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Dhx30Q99PU8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Dhx30Q99PU8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Dhx30Q99PU8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Dhx30Q99PU8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Dhx30Q99PU8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Dhx30Q99PU8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Dhx30Q99PU8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Dhx30Q99PU8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Dhx30Q99PU8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Dhx30Q99PU8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Dhx30Q99PU8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Dhx30Q99PU8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Dhx30Q99PU8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Dhx30Q99PU8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Dhx30Q99PU8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms