Protein–RNA interactions for Protein: Q99PF4

Cdh23, Cadherin-23, mousemouse

Predictions only

Length 3,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh23Q99PF4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdh23Q99PF4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdh23Q99PF4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdh23Q99PF4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdh23Q99PF4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdh23Q99PF4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdh23Q99PF4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdh23Q99PF4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdh23Q99PF4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdh23Q99PF4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdh23Q99PF4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdh23Q99PF4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdh23Q99PF4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdh23Q99PF4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdh23Q99PF4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdh23Q99PF4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdh23Q99PF4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cdh23Q99PF4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdh23Q99PF4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdh23Q99PF4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdh23Q99PF4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdh23Q99PF4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdh23Q99PF4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdh23Q99PF4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdh23Q99PF4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdh23Q99PF4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdh23Q99PF4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdh23Q99PF4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdh23Q99PF4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdh23Q99PF4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdh23Q99PF4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdh23Q99PF4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdh23Q99PF4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdh23Q99PF4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdh23Q99PF4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdh23Q99PF4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdh23Q99PF4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdh23Q99PF4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdh23Q99PF4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdh23Q99PF4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdh23Q99PF4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdh23Q99PF4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cdh23Q99PF4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cdh23Q99PF4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdh23Q99PF4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdh23Q99PF4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdh23Q99PF4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdh23Q99PF4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdh23Q99PF4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdh23Q99PF4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdh23Q99PF4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdh23Q99PF4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdh23Q99PF4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cdh23Q99PF4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdh23Q99PF4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdh23Q99PF4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdh23Q99PF4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdh23Q99PF4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdh23Q99PF4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdh23Q99PF4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdh23Q99PF4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdh23Q99PF4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdh23Q99PF4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdh23Q99PF4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdh23Q99PF4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdh23Q99PF4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdh23Q99PF4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdh23Q99PF4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdh23Q99PF4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdh23Q99PF4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdh23Q99PF4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdh23Q99PF4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdh23Q99PF4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdh23Q99PF4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdh23Q99PF4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdh23Q99PF4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdh23Q99PF4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdh23Q99PF4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdh23Q99PF4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdh23Q99PF4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdh23Q99PF4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdh23Q99PF4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdh23Q99PF4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdh23Q99PF4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdh23Q99PF4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdh23Q99PF4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdh23Q99PF4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdh23Q99PF4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdh23Q99PF4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdh23Q99PF4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdh23Q99PF4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdh23Q99PF4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdh23Q99PF4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdh23Q99PF4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdh23Q99PF4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdh23Q99PF4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdh23Q99PF4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cdh23Q99PF4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdh23Q99PF4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdh23Q99PF4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms