Protein–RNA interactions for Protein: Q99N89

Mrpl43, 39S ribosomal protein L43, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl43Q99N89 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl43Q99N89 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl43Q99N89 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mrpl43Q99N89 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mrpl43Q99N89 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mrpl43Q99N89 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mrpl43Q99N89 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Mrpl43Q99N89 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mrpl43Q99N89 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mrpl43Q99N89 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mrpl43Q99N89 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mrpl43Q99N89 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mrpl43Q99N89 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mrpl43Q99N89 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mrpl43Q99N89 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mrpl43Q99N89 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mrpl43Q99N89 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mrpl43Q99N89 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mrpl43Q99N89 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mrpl43Q99N89 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mrpl43Q99N89 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mrpl43Q99N89 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mrpl43Q99N89 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mrpl43Q99N89 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mrpl43Q99N89 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mrpl43Q99N89 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Mrpl43Q99N89 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Mrpl43Q99N89 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Mrpl43Q99N89 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mrpl43Q99N89 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mrpl43Q99N89 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mrpl43Q99N89 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mrpl43Q99N89 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Mrpl43Q99N89 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mrpl43Q99N89 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mrpl43Q99N89 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Mrpl43Q99N89 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Mrpl43Q99N89 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Mrpl43Q99N89 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Mrpl43Q99N89 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mrpl43Q99N89 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Mrpl43Q99N89 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mrpl43Q99N89 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mrpl43Q99N89 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mrpl43Q99N89 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mrpl43Q99N89 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mrpl43Q99N89 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mrpl43Q99N89 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mrpl43Q99N89 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Mrpl43Q99N89 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mrpl43Q99N89 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mrpl43Q99N89 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mrpl43Q99N89 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mrpl43Q99N89 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mrpl43Q99N89 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Mrpl43Q99N89 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mrpl43Q99N89 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mrpl43Q99N89 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mrpl43Q99N89 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mrpl43Q99N89 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mrpl43Q99N89 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mrpl43Q99N89 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mrpl43Q99N89 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mrpl43Q99N89 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mrpl43Q99N89 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mrpl43Q99N89 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mrpl43Q99N89 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mrpl43Q99N89 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mrpl43Q99N89 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mrpl43Q99N89 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mrpl43Q99N89 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mrpl43Q99N89 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mrpl43Q99N89 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mrpl43Q99N89 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mrpl43Q99N89 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mrpl43Q99N89 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mrpl43Q99N89 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mrpl43Q99N89 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mrpl43Q99N89 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mrpl43Q99N89 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mrpl43Q99N89 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mrpl43Q99N89 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mrpl43Q99N89 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mrpl43Q99N89 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mrpl43Q99N89 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mrpl43Q99N89 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mrpl43Q99N89 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mrpl43Q99N89 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mrpl43Q99N89 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mrpl43Q99N89 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mrpl43Q99N89 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mrpl43Q99N89 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Mrpl43Q99N89 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mrpl43Q99N89 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mrpl43Q99N89 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mrpl43Q99N89 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mrpl43Q99N89 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mrpl43Q99N89 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mrpl43Q99N89 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mrpl43Q99N89 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.6 ms