Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Brms1Q99N20 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Brms1Q99N20 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Brms1Q99N20 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Brms1Q99N20 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Brms1Q99N20 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Brms1Q99N20 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Brms1Q99N20 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Brms1Q99N20 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Brms1Q99N20 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Brms1Q99N20 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Brms1Q99N20 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Brms1Q99N20 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Brms1Q99N20 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Brms1Q99N20 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Brms1Q99N20 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Brms1Q99N20 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Brms1Q99N20 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Brms1Q99N20 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Brms1Q99N20 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Brms1Q99N20 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Brms1Q99N20 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Brms1Q99N20 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Brms1Q99N20 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Brms1Q99N20 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Brms1Q99N20 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Brms1Q99N20 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Brms1Q99N20 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Brms1Q99N20 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Brms1Q99N20 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Brms1Q99N20 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Brms1Q99N20 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Brms1Q99N20 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Brms1Q99N20 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Brms1Q99N20 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Brms1Q99N20 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Brms1Q99N20 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Brms1Q99N20 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Brms1Q99N20 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Brms1Q99N20 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Brms1Q99N20 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Brms1Q99N20 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Brms1Q99N20 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Brms1Q99N20 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Brms1Q99N20 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Brms1Q99N20 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Brms1Q99N20 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Brms1Q99N20 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Brms1Q99N20 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Brms1Q99N20 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Brms1Q99N20 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Brms1Q99N20 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Brms1Q99N20 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Brms1Q99N20 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Brms1Q99N20 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Brms1Q99N20 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Brms1Q99N20 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Brms1Q99N20 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Brms1Q99N20 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Brms1Q99N20 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Brms1Q99N20 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Brms1Q99N20 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Brms1Q99N20 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Brms1Q99N20 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Brms1Q99N20 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Brms1Q99N20 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Brms1Q99N20 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Brms1Q99N20 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Brms1Q99N20 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Brms1Q99N20 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Brms1Q99N20 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Brms1Q99N20 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Brms1Q99N20 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Brms1Q99N20 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Brms1Q99N20 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Brms1Q99N20 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Brms1Q99N20 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Brms1Q99N20 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Brms1Q99N20 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Brms1Q99N20 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Brms1Q99N20 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Brms1Q99N20 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Brms1Q99N20 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Brms1Q99N20 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Brms1Q99N20 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Brms1Q99N20 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Brms1Q99N20 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Brms1Q99N20 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Brms1Q99N20 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Brms1Q99N20 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Brms1Q99N20 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Brms1Q99N20 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Brms1Q99N20 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Brms1Q99N20 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Brms1Q99N20 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Brms1Q99N20 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Brms1Q99N20 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Brms1Q99N20 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Brms1Q99N20 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Brms1Q99N20 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.2 ms