Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gtpbp4Q99ME9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gtpbp4Q99ME9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gtpbp4Q99ME9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Gtpbp4Q99ME9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gtpbp4Q99ME9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gtpbp4Q99ME9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gtpbp4Q99ME9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gtpbp4Q99ME9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gtpbp4Q99ME9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gtpbp4Q99ME9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gtpbp4Q99ME9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gtpbp4Q99ME9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gtpbp4Q99ME9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gtpbp4Q99ME9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gtpbp4Q99ME9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gtpbp4Q99ME9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gtpbp4Q99ME9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gtpbp4Q99ME9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Gtpbp4Q99ME9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gtpbp4Q99ME9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Gtpbp4Q99ME9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gtpbp4Q99ME9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gtpbp4Q99ME9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gtpbp4Q99ME9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gtpbp4Q99ME9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gtpbp4Q99ME9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gtpbp4Q99ME9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gtpbp4Q99ME9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gtpbp4Q99ME9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gtpbp4Q99ME9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Gtpbp4Q99ME9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gtpbp4Q99ME9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Gtpbp4Q99ME9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gtpbp4Q99ME9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gtpbp4Q99ME9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gtpbp4Q99ME9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gtpbp4Q99ME9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gtpbp4Q99ME9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gtpbp4Q99ME9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gtpbp4Q99ME9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gtpbp4Q99ME9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gtpbp4Q99ME9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gtpbp4Q99ME9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gtpbp4Q99ME9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gtpbp4Q99ME9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gtpbp4Q99ME9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gtpbp4Q99ME9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gtpbp4Q99ME9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gtpbp4Q99ME9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gtpbp4Q99ME9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gtpbp4Q99ME9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gtpbp4Q99ME9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gtpbp4Q99ME9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Gtpbp4Q99ME9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gtpbp4Q99ME9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gtpbp4Q99ME9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gtpbp4Q99ME9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gtpbp4Q99ME9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gtpbp4Q99ME9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gtpbp4Q99ME9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gtpbp4Q99ME9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gtpbp4Q99ME9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gtpbp4Q99ME9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gtpbp4Q99ME9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gtpbp4Q99ME9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gtpbp4Q99ME9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gtpbp4Q99ME9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gtpbp4Q99ME9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gtpbp4Q99ME9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gtpbp4Q99ME9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gtpbp4Q99ME9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gtpbp4Q99ME9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gtpbp4Q99ME9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gtpbp4Q99ME9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gtpbp4Q99ME9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gtpbp4Q99ME9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gtpbp4Q99ME9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gtpbp4Q99ME9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gtpbp4Q99ME9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gtpbp4Q99ME9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gtpbp4Q99ME9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gtpbp4Q99ME9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gtpbp4Q99ME9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gtpbp4Q99ME9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gtpbp4Q99ME9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gtpbp4Q99ME9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gtpbp4Q99ME9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gtpbp4Q99ME9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gtpbp4Q99ME9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gtpbp4Q99ME9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gtpbp4Q99ME9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gtpbp4Q99ME9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gtpbp4Q99ME9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gtpbp4Q99ME9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gtpbp4Q99ME9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Gtpbp4Q99ME9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gtpbp4Q99ME9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gtpbp4Q99ME9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gtpbp4Q99ME9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms