Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ5

Cmtm3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm3Q99LJ5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cmtm3Q99LJ5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cmtm3Q99LJ5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cmtm3Q99LJ5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cmtm3Q99LJ5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cmtm3Q99LJ5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cmtm3Q99LJ5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cmtm3Q99LJ5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cmtm3Q99LJ5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cmtm3Q99LJ5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cmtm3Q99LJ5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cmtm3Q99LJ5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cmtm3Q99LJ5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cmtm3Q99LJ5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cmtm3Q99LJ5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cmtm3Q99LJ5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cmtm3Q99LJ5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cmtm3Q99LJ5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cmtm3Q99LJ5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cmtm3Q99LJ5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cmtm3Q99LJ5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cmtm3Q99LJ5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cmtm3Q99LJ5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cmtm3Q99LJ5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cmtm3Q99LJ5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cmtm3Q99LJ5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cmtm3Q99LJ5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cmtm3Q99LJ5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cmtm3Q99LJ5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cmtm3Q99LJ5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cmtm3Q99LJ5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cmtm3Q99LJ5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cmtm3Q99LJ5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cmtm3Q99LJ5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cmtm3Q99LJ5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cmtm3Q99LJ5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cmtm3Q99LJ5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cmtm3Q99LJ5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cmtm3Q99LJ5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cmtm3Q99LJ5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cmtm3Q99LJ5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cmtm3Q99LJ5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cmtm3Q99LJ5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cmtm3Q99LJ5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cmtm3Q99LJ5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cmtm3Q99LJ5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cmtm3Q99LJ5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cmtm3Q99LJ5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cmtm3Q99LJ5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cmtm3Q99LJ5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cmtm3Q99LJ5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cmtm3Q99LJ5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cmtm3Q99LJ5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cmtm3Q99LJ5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cmtm3Q99LJ5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cmtm3Q99LJ5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cmtm3Q99LJ5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cmtm3Q99LJ5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cmtm3Q99LJ5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cmtm3Q99LJ5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cmtm3Q99LJ5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cmtm3Q99LJ5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cmtm3Q99LJ5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cmtm3Q99LJ5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cmtm3Q99LJ5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cmtm3Q99LJ5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cmtm3Q99LJ5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cmtm3Q99LJ5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cmtm3Q99LJ5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cmtm3Q99LJ5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cmtm3Q99LJ5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cmtm3Q99LJ5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cmtm3Q99LJ5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cmtm3Q99LJ5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cmtm3Q99LJ5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cmtm3Q99LJ5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cmtm3Q99LJ5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cmtm3Q99LJ5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cmtm3Q99LJ5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cmtm3Q99LJ5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cmtm3Q99LJ5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cmtm3Q99LJ5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cmtm3Q99LJ5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cmtm3Q99LJ5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cmtm3Q99LJ5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cmtm3Q99LJ5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cmtm3Q99LJ5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cmtm3Q99LJ5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cmtm3Q99LJ5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cmtm3Q99LJ5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cmtm3Q99LJ5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cmtm3Q99LJ5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cmtm3Q99LJ5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cmtm3Q99LJ5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cmtm3Q99LJ5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cmtm3Q99LJ5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cmtm3Q99LJ5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cmtm3Q99LJ5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cmtm3Q99LJ5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cmtm3Q99LJ5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms