Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abcf2Q99LE6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Abcf2Q99LE6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Abcf2Q99LE6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Abcf2Q99LE6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Abcf2Q99LE6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Abcf2Q99LE6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Abcf2Q99LE6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Abcf2Q99LE6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Abcf2Q99LE6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Abcf2Q99LE6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Abcf2Q99LE6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Abcf2Q99LE6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Abcf2Q99LE6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Abcf2Q99LE6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Abcf2Q99LE6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Abcf2Q99LE6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Abcf2Q99LE6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Abcf2Q99LE6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Abcf2Q99LE6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Abcf2Q99LE6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Abcf2Q99LE6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Abcf2Q99LE6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Abcf2Q99LE6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Abcf2Q99LE6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Abcf2Q99LE6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Abcf2Q99LE6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Abcf2Q99LE6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Abcf2Q99LE6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Abcf2Q99LE6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Abcf2Q99LE6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Abcf2Q99LE6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Abcf2Q99LE6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Abcf2Q99LE6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Abcf2Q99LE6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Abcf2Q99LE6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Abcf2Q99LE6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Abcf2Q99LE6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcf2Q99LE6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcf2Q99LE6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcf2Q99LE6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcf2Q99LE6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcf2Q99LE6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcf2Q99LE6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcf2Q99LE6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcf2Q99LE6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcf2Q99LE6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcf2Q99LE6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Abcf2Q99LE6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Abcf2Q99LE6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Abcf2Q99LE6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Abcf2Q99LE6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Abcf2Q99LE6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Abcf2Q99LE6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Abcf2Q99LE6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Abcf2Q99LE6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Abcf2Q99LE6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Abcf2Q99LE6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Abcf2Q99LE6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Abcf2Q99LE6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Abcf2Q99LE6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Abcf2Q99LE6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Abcf2Q99LE6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Abcf2Q99LE6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Abcf2Q99LE6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Abcf2Q99LE6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Abcf2Q99LE6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Abcf2Q99LE6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Abcf2Q99LE6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abcf2Q99LE6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Abcf2Q99LE6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Abcf2Q99LE6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Abcf2Q99LE6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Abcf2Q99LE6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Abcf2Q99LE6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Abcf2Q99LE6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Abcf2Q99LE6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Abcf2Q99LE6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Abcf2Q99LE6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Abcf2Q99LE6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Abcf2Q99LE6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Abcf2Q99LE6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Abcf2Q99LE6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Abcf2Q99LE6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Abcf2Q99LE6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Abcf2Q99LE6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Abcf2Q99LE6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Abcf2Q99LE6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Abcf2Q99LE6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Abcf2Q99LE6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Abcf2Q99LE6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Abcf2Q99LE6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Abcf2Q99LE6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Abcf2Q99LE6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Abcf2Q99LE6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Abcf2Q99LE6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Abcf2Q99LE6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Abcf2Q99LE6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Abcf2Q99LE6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Abcf2Q99LE6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms