Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE3

Lysmd3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd3Q99LE3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lysmd3Q99LE3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lysmd3Q99LE3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lysmd3Q99LE3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lysmd3Q99LE3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lysmd3Q99LE3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lysmd3Q99LE3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lysmd3Q99LE3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lysmd3Q99LE3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lysmd3Q99LE3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lysmd3Q99LE3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lysmd3Q99LE3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lysmd3Q99LE3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lysmd3Q99LE3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lysmd3Q99LE3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lysmd3Q99LE3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lysmd3Q99LE3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lysmd3Q99LE3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lysmd3Q99LE3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lysmd3Q99LE3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lysmd3Q99LE3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lysmd3Q99LE3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lysmd3Q99LE3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lysmd3Q99LE3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lysmd3Q99LE3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lysmd3Q99LE3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lysmd3Q99LE3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lysmd3Q99LE3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lysmd3Q99LE3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lysmd3Q99LE3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lysmd3Q99LE3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lysmd3Q99LE3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lysmd3Q99LE3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lysmd3Q99LE3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lysmd3Q99LE3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lysmd3Q99LE3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lysmd3Q99LE3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lysmd3Q99LE3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lysmd3Q99LE3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lysmd3Q99LE3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lysmd3Q99LE3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lysmd3Q99LE3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lysmd3Q99LE3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lysmd3Q99LE3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lysmd3Q99LE3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lysmd3Q99LE3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lysmd3Q99LE3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lysmd3Q99LE3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lysmd3Q99LE3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lysmd3Q99LE3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lysmd3Q99LE3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lysmd3Q99LE3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lysmd3Q99LE3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lysmd3Q99LE3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lysmd3Q99LE3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lysmd3Q99LE3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lysmd3Q99LE3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lysmd3Q99LE3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lysmd3Q99LE3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lysmd3Q99LE3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lysmd3Q99LE3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lysmd3Q99LE3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lysmd3Q99LE3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lysmd3Q99LE3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Lysmd3Q99LE3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lysmd3Q99LE3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lysmd3Q99LE3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lysmd3Q99LE3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Lysmd3Q99LE3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lysmd3Q99LE3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lysmd3Q99LE3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lysmd3Q99LE3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lysmd3Q99LE3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lysmd3Q99LE3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lysmd3Q99LE3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lysmd3Q99LE3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lysmd3Q99LE3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Lysmd3Q99LE3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lysmd3Q99LE3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lysmd3Q99LE3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lysmd3Q99LE3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lysmd3Q99LE3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lysmd3Q99LE3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lysmd3Q99LE3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lysmd3Q99LE3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lysmd3Q99LE3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lysmd3Q99LE3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lysmd3Q99LE3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lysmd3Q99LE3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Lysmd3Q99LE3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lysmd3Q99LE3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lysmd3Q99LE3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lysmd3Q99LE3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lysmd3Q99LE3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lysmd3Q99LE3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lysmd3Q99LE3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lysmd3Q99LE3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lysmd3Q99LE3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Lysmd3Q99LE3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Lysmd3Q99LE3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms