Protein–RNA interactions for Protein: Q99LB7

Sardh, Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SardhQ99LB7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SardhQ99LB7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SardhQ99LB7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SardhQ99LB7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SardhQ99LB7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SardhQ99LB7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SardhQ99LB7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SardhQ99LB7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SardhQ99LB7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SardhQ99LB7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SardhQ99LB7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SardhQ99LB7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SardhQ99LB7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SardhQ99LB7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SardhQ99LB7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SardhQ99LB7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SardhQ99LB7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SardhQ99LB7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SardhQ99LB7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SardhQ99LB7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SardhQ99LB7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SardhQ99LB7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SardhQ99LB7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SardhQ99LB7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SardhQ99LB7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SardhQ99LB7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SardhQ99LB7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SardhQ99LB7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SardhQ99LB7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SardhQ99LB7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SardhQ99LB7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SardhQ99LB7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SardhQ99LB7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SardhQ99LB7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SardhQ99LB7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SardhQ99LB7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SardhQ99LB7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SardhQ99LB7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SardhQ99LB7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SardhQ99LB7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SardhQ99LB7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SardhQ99LB7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SardhQ99LB7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SardhQ99LB7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SardhQ99LB7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SardhQ99LB7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SardhQ99LB7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SardhQ99LB7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SardhQ99LB7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SardhQ99LB7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SardhQ99LB7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SardhQ99LB7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SardhQ99LB7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SardhQ99LB7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SardhQ99LB7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SardhQ99LB7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SardhQ99LB7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SardhQ99LB7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SardhQ99LB7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SardhQ99LB7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SardhQ99LB7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SardhQ99LB7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SardhQ99LB7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SardhQ99LB7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SardhQ99LB7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SardhQ99LB7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SardhQ99LB7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SardhQ99LB7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SardhQ99LB7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SardhQ99LB7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SardhQ99LB7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SardhQ99LB7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SardhQ99LB7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SardhQ99LB7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SardhQ99LB7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SardhQ99LB7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SardhQ99LB7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SardhQ99LB7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SardhQ99LB7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SardhQ99LB7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SardhQ99LB7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SardhQ99LB7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SardhQ99LB7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SardhQ99LB7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SardhQ99LB7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SardhQ99LB7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SardhQ99LB7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SardhQ99LB7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SardhQ99LB7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SardhQ99LB7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SardhQ99LB7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SardhQ99LB7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SardhQ99LB7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SardhQ99LB7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SardhQ99LB7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SardhQ99LB7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SardhQ99LB7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SardhQ99LB7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SardhQ99LB7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SardhQ99LB7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms