Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TriobpQ99KW3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TriobpQ99KW3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TriobpQ99KW3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TriobpQ99KW3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TriobpQ99KW3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TriobpQ99KW3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TriobpQ99KW3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TriobpQ99KW3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TriobpQ99KW3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TriobpQ99KW3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TriobpQ99KW3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TriobpQ99KW3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TriobpQ99KW3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TriobpQ99KW3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TriobpQ99KW3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TriobpQ99KW3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TriobpQ99KW3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TriobpQ99KW3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TriobpQ99KW3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TriobpQ99KW3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TriobpQ99KW3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TriobpQ99KW3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TriobpQ99KW3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TriobpQ99KW3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TriobpQ99KW3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TriobpQ99KW3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TriobpQ99KW3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TriobpQ99KW3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TriobpQ99KW3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TriobpQ99KW3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TriobpQ99KW3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TriobpQ99KW3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TriobpQ99KW3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TriobpQ99KW3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TriobpQ99KW3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TriobpQ99KW3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TriobpQ99KW3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TriobpQ99KW3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TriobpQ99KW3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TriobpQ99KW3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TriobpQ99KW3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TriobpQ99KW3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TriobpQ99KW3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TriobpQ99KW3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TriobpQ99KW3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TriobpQ99KW3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TriobpQ99KW3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TriobpQ99KW3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TriobpQ99KW3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TriobpQ99KW3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TriobpQ99KW3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TriobpQ99KW3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TriobpQ99KW3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TriobpQ99KW3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TriobpQ99KW3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TriobpQ99KW3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TriobpQ99KW3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TriobpQ99KW3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TriobpQ99KW3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TriobpQ99KW3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TriobpQ99KW3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TriobpQ99KW3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TriobpQ99KW3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TriobpQ99KW3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TriobpQ99KW3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TriobpQ99KW3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TriobpQ99KW3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TriobpQ99KW3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TriobpQ99KW3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TriobpQ99KW3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TriobpQ99KW3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TriobpQ99KW3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TriobpQ99KW3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TriobpQ99KW3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TriobpQ99KW3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TriobpQ99KW3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TriobpQ99KW3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TriobpQ99KW3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TriobpQ99KW3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TriobpQ99KW3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TriobpQ99KW3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TriobpQ99KW3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TriobpQ99KW3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TriobpQ99KW3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TriobpQ99KW3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TriobpQ99KW3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TriobpQ99KW3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TriobpQ99KW3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TriobpQ99KW3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TriobpQ99KW3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TriobpQ99KW3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TriobpQ99KW3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TriobpQ99KW3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TriobpQ99KW3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TriobpQ99KW3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TriobpQ99KW3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TriobpQ99KW3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TriobpQ99KW3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TriobpQ99KW3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms