Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ5

Tcf19, Transcription factor 19-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf19Q99KJ5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcf19Q99KJ5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcf19Q99KJ5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcf19Q99KJ5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tcf19Q99KJ5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tcf19Q99KJ5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tcf19Q99KJ5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tcf19Q99KJ5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcf19Q99KJ5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcf19Q99KJ5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcf19Q99KJ5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcf19Q99KJ5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcf19Q99KJ5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tcf19Q99KJ5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tcf19Q99KJ5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tcf19Q99KJ5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tcf19Q99KJ5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tcf19Q99KJ5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tcf19Q99KJ5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tcf19Q99KJ5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tcf19Q99KJ5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tcf19Q99KJ5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tcf19Q99KJ5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tcf19Q99KJ5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tcf19Q99KJ5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tcf19Q99KJ5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tcf19Q99KJ5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tcf19Q99KJ5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tcf19Q99KJ5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tcf19Q99KJ5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tcf19Q99KJ5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tcf19Q99KJ5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tcf19Q99KJ5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tcf19Q99KJ5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tcf19Q99KJ5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tcf19Q99KJ5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tcf19Q99KJ5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcf19Q99KJ5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcf19Q99KJ5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcf19Q99KJ5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcf19Q99KJ5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcf19Q99KJ5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcf19Q99KJ5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tcf19Q99KJ5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tcf19Q99KJ5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tcf19Q99KJ5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tcf19Q99KJ5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tcf19Q99KJ5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcf19Q99KJ5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcf19Q99KJ5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcf19Q99KJ5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcf19Q99KJ5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcf19Q99KJ5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcf19Q99KJ5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcf19Q99KJ5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcf19Q99KJ5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcf19Q99KJ5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcf19Q99KJ5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcf19Q99KJ5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcf19Q99KJ5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tcf19Q99KJ5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Tcf19Q99KJ5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tcf19Q99KJ5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tcf19Q99KJ5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tcf19Q99KJ5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tcf19Q99KJ5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tcf19Q99KJ5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tcf19Q99KJ5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tcf19Q99KJ5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tcf19Q99KJ5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tcf19Q99KJ5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tcf19Q99KJ5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tcf19Q99KJ5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Tcf19Q99KJ5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tcf19Q99KJ5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tcf19Q99KJ5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tcf19Q99KJ5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tcf19Q99KJ5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tcf19Q99KJ5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tcf19Q99KJ5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tcf19Q99KJ5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tcf19Q99KJ5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tcf19Q99KJ5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tcf19Q99KJ5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tcf19Q99KJ5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tcf19Q99KJ5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tcf19Q99KJ5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tcf19Q99KJ5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tcf19Q99KJ5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tcf19Q99KJ5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tcf19Q99KJ5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tcf19Q99KJ5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tcf19Q99KJ5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tcf19Q99KJ5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tcf19Q99KJ5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tcf19Q99KJ5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tcf19Q99KJ5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tcf19Q99KJ5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tcf19Q99KJ5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tcf19Q99KJ5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms