Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Higd1bQ99JY6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Higd1bQ99JY6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Higd1bQ99JY6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Higd1bQ99JY6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Higd1bQ99JY6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Higd1bQ99JY6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Higd1bQ99JY6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Higd1bQ99JY6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Higd1bQ99JY6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Higd1bQ99JY6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Higd1bQ99JY6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Higd1bQ99JY6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Higd1bQ99JY6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Higd1bQ99JY6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Higd1bQ99JY6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Higd1bQ99JY6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Higd1bQ99JY6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Higd1bQ99JY6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Higd1bQ99JY6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Higd1bQ99JY6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Higd1bQ99JY6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Higd1bQ99JY6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Higd1bQ99JY6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Higd1bQ99JY6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Higd1bQ99JY6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Higd1bQ99JY6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Higd1bQ99JY6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Higd1bQ99JY6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Higd1bQ99JY6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Higd1bQ99JY6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Higd1bQ99JY6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Higd1bQ99JY6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Higd1bQ99JY6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Higd1bQ99JY6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Higd1bQ99JY6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Higd1bQ99JY6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Higd1bQ99JY6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Higd1bQ99JY6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Higd1bQ99JY6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Higd1bQ99JY6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Higd1bQ99JY6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Higd1bQ99JY6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Higd1bQ99JY6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Higd1bQ99JY6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Higd1bQ99JY6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Higd1bQ99JY6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Higd1bQ99JY6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Higd1bQ99JY6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Higd1bQ99JY6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Higd1bQ99JY6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Higd1bQ99JY6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Higd1bQ99JY6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Higd1bQ99JY6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Higd1bQ99JY6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Higd1bQ99JY6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Higd1bQ99JY6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Higd1bQ99JY6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Higd1bQ99JY6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Higd1bQ99JY6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Higd1bQ99JY6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Higd1bQ99JY6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Higd1bQ99JY6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Higd1bQ99JY6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Higd1bQ99JY6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Higd1bQ99JY6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Higd1bQ99JY6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Higd1bQ99JY6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Higd1bQ99JY6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Higd1bQ99JY6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Higd1bQ99JY6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Higd1bQ99JY6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Higd1bQ99JY6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Higd1bQ99JY6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Higd1bQ99JY6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Higd1bQ99JY6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Higd1bQ99JY6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Higd1bQ99JY6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Higd1bQ99JY6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Higd1bQ99JY6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Higd1bQ99JY6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Higd1bQ99JY6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Higd1bQ99JY6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Higd1bQ99JY6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Higd1bQ99JY6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Higd1bQ99JY6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Higd1bQ99JY6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Higd1bQ99JY6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Higd1bQ99JY6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Higd1bQ99JY6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Higd1bQ99JY6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Higd1bQ99JY6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Higd1bQ99JY6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Higd1bQ99JY6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Higd1bQ99JY6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Higd1bQ99JY6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Higd1bQ99JY6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Higd1bQ99JY6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Higd1bQ99JY6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Higd1bQ99JY6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms