Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY1

Tirap, Toll/interleukin-1 receptor domain-containing adapter protein, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TirapQ99JY1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TirapQ99JY1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TirapQ99JY1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TirapQ99JY1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TirapQ99JY1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TirapQ99JY1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TirapQ99JY1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TirapQ99JY1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TirapQ99JY1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TirapQ99JY1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TirapQ99JY1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TirapQ99JY1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TirapQ99JY1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TirapQ99JY1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TirapQ99JY1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TirapQ99JY1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TirapQ99JY1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TirapQ99JY1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TirapQ99JY1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TirapQ99JY1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TirapQ99JY1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TirapQ99JY1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TirapQ99JY1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TirapQ99JY1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TirapQ99JY1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TirapQ99JY1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TirapQ99JY1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TirapQ99JY1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TirapQ99JY1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TirapQ99JY1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TirapQ99JY1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TirapQ99JY1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TirapQ99JY1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TirapQ99JY1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TirapQ99JY1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TirapQ99JY1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TirapQ99JY1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TirapQ99JY1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TirapQ99JY1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TirapQ99JY1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TirapQ99JY1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TirapQ99JY1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TirapQ99JY1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TirapQ99JY1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TirapQ99JY1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TirapQ99JY1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TirapQ99JY1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TirapQ99JY1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TirapQ99JY1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TirapQ99JY1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TirapQ99JY1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TirapQ99JY1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TirapQ99JY1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TirapQ99JY1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TirapQ99JY1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TirapQ99JY1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TirapQ99JY1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TirapQ99JY1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TirapQ99JY1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TirapQ99JY1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TirapQ99JY1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TirapQ99JY1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TirapQ99JY1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TirapQ99JY1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TirapQ99JY1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TirapQ99JY1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TirapQ99JY1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TirapQ99JY1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TirapQ99JY1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TirapQ99JY1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TirapQ99JY1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TirapQ99JY1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TirapQ99JY1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TirapQ99JY1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TirapQ99JY1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TirapQ99JY1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TirapQ99JY1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TirapQ99JY1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TirapQ99JY1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TirapQ99JY1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TirapQ99JY1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TirapQ99JY1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TirapQ99JY1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TirapQ99JY1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TirapQ99JY1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TirapQ99JY1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TirapQ99JY1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TirapQ99JY1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TirapQ99JY1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TirapQ99JY1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TirapQ99JY1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TirapQ99JY1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TirapQ99JY1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TirapQ99JY1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TirapQ99JY1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TirapQ99JY1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TirapQ99JY1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TirapQ99JY1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TirapQ99JY1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TirapQ99JY1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms