Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW1

Abhd17a, Protein ABHD17A, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abhd17aQ99JW1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abhd17aQ99JW1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abhd17aQ99JW1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abhd17aQ99JW1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abhd17aQ99JW1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abhd17aQ99JW1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abhd17aQ99JW1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abhd17aQ99JW1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abhd17aQ99JW1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abhd17aQ99JW1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abhd17aQ99JW1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abhd17aQ99JW1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abhd17aQ99JW1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abhd17aQ99JW1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abhd17aQ99JW1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abhd17aQ99JW1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abhd17aQ99JW1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abhd17aQ99JW1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abhd17aQ99JW1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abhd17aQ99JW1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abhd17aQ99JW1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Abhd17aQ99JW1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abhd17aQ99JW1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abhd17aQ99JW1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abhd17aQ99JW1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abhd17aQ99JW1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abhd17aQ99JW1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abhd17aQ99JW1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abhd17aQ99JW1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abhd17aQ99JW1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abhd17aQ99JW1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abhd17aQ99JW1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Abhd17aQ99JW1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abhd17aQ99JW1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abhd17aQ99JW1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abhd17aQ99JW1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abhd17aQ99JW1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abhd17aQ99JW1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abhd17aQ99JW1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abhd17aQ99JW1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abhd17aQ99JW1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abhd17aQ99JW1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abhd17aQ99JW1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abhd17aQ99JW1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abhd17aQ99JW1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abhd17aQ99JW1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abhd17aQ99JW1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abhd17aQ99JW1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Abhd17aQ99JW1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abhd17aQ99JW1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Abhd17aQ99JW1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abhd17aQ99JW1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abhd17aQ99JW1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abhd17aQ99JW1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abhd17aQ99JW1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abhd17aQ99JW1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abhd17aQ99JW1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abhd17aQ99JW1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abhd17aQ99JW1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abhd17aQ99JW1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abhd17aQ99JW1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abhd17aQ99JW1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abhd17aQ99JW1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abhd17aQ99JW1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abhd17aQ99JW1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Abhd17aQ99JW1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abhd17aQ99JW1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abhd17aQ99JW1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abhd17aQ99JW1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Abhd17aQ99JW1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abhd17aQ99JW1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abhd17aQ99JW1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abhd17aQ99JW1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abhd17aQ99JW1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abhd17aQ99JW1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Abhd17aQ99JW1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abhd17aQ99JW1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abhd17aQ99JW1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abhd17aQ99JW1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abhd17aQ99JW1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Abhd17aQ99JW1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abhd17aQ99JW1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Abhd17aQ99JW1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Abhd17aQ99JW1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abhd17aQ99JW1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abhd17aQ99JW1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abhd17aQ99JW1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abhd17aQ99JW1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abhd17aQ99JW1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Abhd17aQ99JW1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abhd17aQ99JW1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abhd17aQ99JW1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abhd17aQ99JW1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Abhd17aQ99JW1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Abhd17aQ99JW1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Abhd17aQ99JW1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Abhd17aQ99JW1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Abhd17aQ99JW1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Abhd17aQ99JW1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Abhd17aQ99JW1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms