Protein–RNA interactions for Protein: Q923K4

Gtpbp3, tRNA modification GTPase GTPBP3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp3Q923K4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtpbp3Q923K4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtpbp3Q923K4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtpbp3Q923K4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtpbp3Q923K4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtpbp3Q923K4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtpbp3Q923K4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtpbp3Q923K4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtpbp3Q923K4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtpbp3Q923K4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtpbp3Q923K4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtpbp3Q923K4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtpbp3Q923K4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtpbp3Q923K4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtpbp3Q923K4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtpbp3Q923K4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtpbp3Q923K4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gtpbp3Q923K4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gtpbp3Q923K4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtpbp3Q923K4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtpbp3Q923K4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtpbp3Q923K4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtpbp3Q923K4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtpbp3Q923K4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtpbp3Q923K4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtpbp3Q923K4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtpbp3Q923K4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtpbp3Q923K4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtpbp3Q923K4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtpbp3Q923K4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtpbp3Q923K4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtpbp3Q923K4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtpbp3Q923K4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtpbp3Q923K4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtpbp3Q923K4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtpbp3Q923K4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtpbp3Q923K4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtpbp3Q923K4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtpbp3Q923K4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Gtpbp3Q923K4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtpbp3Q923K4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtpbp3Q923K4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtpbp3Q923K4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtpbp3Q923K4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtpbp3Q923K4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtpbp3Q923K4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtpbp3Q923K4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtpbp3Q923K4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtpbp3Q923K4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtpbp3Q923K4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtpbp3Q923K4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtpbp3Q923K4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtpbp3Q923K4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtpbp3Q923K4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtpbp3Q923K4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtpbp3Q923K4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtpbp3Q923K4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtpbp3Q923K4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtpbp3Q923K4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtpbp3Q923K4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtpbp3Q923K4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtpbp3Q923K4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtpbp3Q923K4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtpbp3Q923K4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtpbp3Q923K4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtpbp3Q923K4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtpbp3Q923K4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtpbp3Q923K4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtpbp3Q923K4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtpbp3Q923K4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtpbp3Q923K4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtpbp3Q923K4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtpbp3Q923K4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtpbp3Q923K4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtpbp3Q923K4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtpbp3Q923K4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Gtpbp3Q923K4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gtpbp3Q923K4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gtpbp3Q923K4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtpbp3Q923K4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtpbp3Q923K4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtpbp3Q923K4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtpbp3Q923K4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtpbp3Q923K4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtpbp3Q923K4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtpbp3Q923K4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtpbp3Q923K4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtpbp3Q923K4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtpbp3Q923K4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtpbp3Q923K4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtpbp3Q923K4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtpbp3Q923K4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtpbp3Q923K4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtpbp3Q923K4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtpbp3Q923K4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtpbp3Q923K4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtpbp3Q923K4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtpbp3Q923K4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtpbp3Q923K4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtpbp3Q923K4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms