Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Clip1Q922J3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Clip1Q922J3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
Clip1Q922J3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Clip1Q922J3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC37.88■■■■□ 3.66
Clip1Q922J3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Clip1Q922J3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC37.87■■■■□ 3.65
Clip1Q922J3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Clip1Q922J3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Clip1Q922J3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Clip1Q922J3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Clip1Q922J3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
Clip1Q922J3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
Clip1Q922J3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
Clip1Q922J3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
Clip1Q922J3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Clip1Q922J3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
Clip1Q922J3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
Clip1Q922J3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Clip1Q922J3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Clip1Q922J3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
Clip1Q922J3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Clip1Q922J3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC37.76■■■■□ 3.64
Clip1Q922J3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Clip1Q922J3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
Clip1Q922J3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
Clip1Q922J3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Clip1Q922J3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
Clip1Q922J3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC37.73■■■■□ 3.63
Clip1Q922J3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Clip1Q922J3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Clip1Q922J3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Clip1Q922J3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Clip1Q922J3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
Clip1Q922J3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Clip1Q922J3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Clip1Q922J3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
Clip1Q922J3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
Clip1Q922J3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
Clip1Q922J3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Clip1Q922J3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Clip1Q922J3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
Clip1Q922J3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Clip1Q922J3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
Clip1Q922J3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
Clip1Q922J3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
Clip1Q922J3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Clip1Q922J3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Clip1Q922J3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
Clip1Q922J3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Clip1Q922J3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
Clip1Q922J3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
Clip1Q922J3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
Clip1Q922J3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Clip1Q922J3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Clip1Q922J3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
Clip1Q922J3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
Clip1Q922J3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Clip1Q922J3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Clip1Q922J3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Clip1Q922J3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Clip1Q922J3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Clip1Q922J3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Clip1Q922J3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Clip1Q922J3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
Clip1Q922J3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Clip1Q922J3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
Clip1Q922J3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.59
Clip1Q922J3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC37.51■■■■□ 3.59
Clip1Q922J3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
Clip1Q922J3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC37.49■■■■□ 3.59
Clip1Q922J3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
Clip1Q922J3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Clip1Q922J3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Clip1Q922J3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Clip1Q922J3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Clip1Q922J3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Clip1Q922J3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Clip1Q922J3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Clip1Q922J3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
Clip1Q922J3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Clip1Q922J3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Clip1Q922J3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Clip1Q922J3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Clip1Q922J3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
Clip1Q922J3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
Clip1Q922J3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
Clip1Q922J3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
Clip1Q922J3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
Clip1Q922J3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Clip1Q922J3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Clip1Q922J3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Clip1Q922J3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Clip1Q922J3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Clip1Q922J3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Clip1Q922J3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Clip1Q922J3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Clip1Q922J3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Clip1Q922J3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
Clip1Q922J3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms