Protein–RNA interactions for Protein: Q920Q6

Msi2, RNA-binding protein Musashi homolog 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi2Q920Q6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Msi2Q920Q6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Msi2Q920Q6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Msi2Q920Q6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Msi2Q920Q6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Msi2Q920Q6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Msi2Q920Q6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Msi2Q920Q6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Msi2Q920Q6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Msi2Q920Q6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Msi2Q920Q6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Msi2Q920Q6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Msi2Q920Q6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Msi2Q920Q6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Msi2Q920Q6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Msi2Q920Q6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Msi2Q920Q6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Msi2Q920Q6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Msi2Q920Q6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Msi2Q920Q6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Msi2Q920Q6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Msi2Q920Q6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Msi2Q920Q6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Msi2Q920Q6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Msi2Q920Q6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Msi2Q920Q6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Msi2Q920Q6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Msi2Q920Q6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Msi2Q920Q6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Msi2Q920Q6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Msi2Q920Q6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Msi2Q920Q6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Msi2Q920Q6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Msi2Q920Q6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Msi2Q920Q6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Msi2Q920Q6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Msi2Q920Q6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Msi2Q920Q6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Msi2Q920Q6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Msi2Q920Q6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Msi2Q920Q6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Msi2Q920Q6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Msi2Q920Q6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Msi2Q920Q6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Msi2Q920Q6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Msi2Q920Q6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Msi2Q920Q6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Msi2Q920Q6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Msi2Q920Q6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Msi2Q920Q6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Msi2Q920Q6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Msi2Q920Q6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Msi2Q920Q6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Msi2Q920Q6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Msi2Q920Q6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Msi2Q920Q6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Msi2Q920Q6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Msi2Q920Q6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Msi2Q920Q6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Msi2Q920Q6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Msi2Q920Q6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Msi2Q920Q6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Msi2Q920Q6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Msi2Q920Q6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Msi2Q920Q6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Msi2Q920Q6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Msi2Q920Q6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Msi2Q920Q6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Msi2Q920Q6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Msi2Q920Q6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Msi2Q920Q6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Msi2Q920Q6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Msi2Q920Q6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Msi2Q920Q6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Msi2Q920Q6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Msi2Q920Q6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Msi2Q920Q6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Msi2Q920Q6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Msi2Q920Q6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Msi2Q920Q6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Msi2Q920Q6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Msi2Q920Q6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Msi2Q920Q6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Msi2Q920Q6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Msi2Q920Q6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Msi2Q920Q6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Msi2Q920Q6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Msi2Q920Q6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Msi2Q920Q6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Msi2Q920Q6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Msi2Q920Q6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Msi2Q920Q6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Msi2Q920Q6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Msi2Q920Q6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Msi2Q920Q6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Msi2Q920Q6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Msi2Q920Q6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Msi2Q920Q6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Msi2Q920Q6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Msi2Q920Q6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms