Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Odf3Q920N1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Odf3Q920N1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Odf3Q920N1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Odf3Q920N1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Odf3Q920N1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Odf3Q920N1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Odf3Q920N1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Odf3Q920N1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Odf3Q920N1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Odf3Q920N1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Odf3Q920N1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Odf3Q920N1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Odf3Q920N1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Odf3Q920N1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Odf3Q920N1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Odf3Q920N1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Odf3Q920N1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Odf3Q920N1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Odf3Q920N1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Odf3Q920N1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Odf3Q920N1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Odf3Q920N1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Odf3Q920N1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Odf3Q920N1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Odf3Q920N1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Odf3Q920N1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Odf3Q920N1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Odf3Q920N1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Odf3Q920N1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Odf3Q920N1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Odf3Q920N1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Odf3Q920N1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Odf3Q920N1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Odf3Q920N1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Odf3Q920N1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Odf3Q920N1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Odf3Q920N1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Odf3Q920N1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Odf3Q920N1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Odf3Q920N1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Odf3Q920N1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Odf3Q920N1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Odf3Q920N1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Odf3Q920N1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Odf3Q920N1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Odf3Q920N1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Odf3Q920N1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Odf3Q920N1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Odf3Q920N1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Odf3Q920N1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Odf3Q920N1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Odf3Q920N1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Odf3Q920N1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Odf3Q920N1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Odf3Q920N1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Odf3Q920N1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Odf3Q920N1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Odf3Q920N1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Odf3Q920N1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Odf3Q920N1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Odf3Q920N1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Odf3Q920N1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Odf3Q920N1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Odf3Q920N1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Odf3Q920N1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Odf3Q920N1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Odf3Q920N1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Odf3Q920N1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Odf3Q920N1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Odf3Q920N1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Odf3Q920N1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Odf3Q920N1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Odf3Q920N1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Odf3Q920N1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Odf3Q920N1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Odf3Q920N1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Odf3Q920N1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Odf3Q920N1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Odf3Q920N1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Odf3Q920N1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Odf3Q920N1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Odf3Q920N1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Odf3Q920N1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Odf3Q920N1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Odf3Q920N1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Odf3Q920N1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Odf3Q920N1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Odf3Q920N1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Odf3Q920N1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Odf3Q920N1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Odf3Q920N1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Odf3Q920N1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Odf3Q920N1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Odf3Q920N1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Odf3Q920N1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Odf3Q920N1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Odf3Q920N1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Odf3Q920N1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Odf3Q920N1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms