Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZY2

Hrh4, Histamine H4 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hrh4Q91ZY2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hrh4Q91ZY2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hrh4Q91ZY2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hrh4Q91ZY2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hrh4Q91ZY2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hrh4Q91ZY2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hrh4Q91ZY2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hrh4Q91ZY2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hrh4Q91ZY2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Hrh4Q91ZY2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hrh4Q91ZY2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hrh4Q91ZY2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hrh4Q91ZY2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hrh4Q91ZY2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hrh4Q91ZY2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hrh4Q91ZY2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hrh4Q91ZY2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hrh4Q91ZY2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hrh4Q91ZY2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hrh4Q91ZY2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Hrh4Q91ZY2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hrh4Q91ZY2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hrh4Q91ZY2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hrh4Q91ZY2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hrh4Q91ZY2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hrh4Q91ZY2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hrh4Q91ZY2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hrh4Q91ZY2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hrh4Q91ZY2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hrh4Q91ZY2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hrh4Q91ZY2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hrh4Q91ZY2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hrh4Q91ZY2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hrh4Q91ZY2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hrh4Q91ZY2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hrh4Q91ZY2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hrh4Q91ZY2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hrh4Q91ZY2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hrh4Q91ZY2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hrh4Q91ZY2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hrh4Q91ZY2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hrh4Q91ZY2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hrh4Q91ZY2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hrh4Q91ZY2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hrh4Q91ZY2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Hrh4Q91ZY2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hrh4Q91ZY2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hrh4Q91ZY2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hrh4Q91ZY2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hrh4Q91ZY2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hrh4Q91ZY2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hrh4Q91ZY2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hrh4Q91ZY2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hrh4Q91ZY2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hrh4Q91ZY2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hrh4Q91ZY2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hrh4Q91ZY2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hrh4Q91ZY2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hrh4Q91ZY2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hrh4Q91ZY2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hrh4Q91ZY2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hrh4Q91ZY2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hrh4Q91ZY2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hrh4Q91ZY2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hrh4Q91ZY2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Hrh4Q91ZY2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hrh4Q91ZY2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hrh4Q91ZY2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hrh4Q91ZY2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hrh4Q91ZY2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hrh4Q91ZY2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hrh4Q91ZY2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hrh4Q91ZY2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hrh4Q91ZY2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hrh4Q91ZY2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hrh4Q91ZY2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hrh4Q91ZY2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hrh4Q91ZY2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hrh4Q91ZY2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hrh4Q91ZY2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hrh4Q91ZY2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hrh4Q91ZY2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hrh4Q91ZY2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hrh4Q91ZY2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hrh4Q91ZY2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hrh4Q91ZY2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hrh4Q91ZY2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hrh4Q91ZY2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hrh4Q91ZY2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hrh4Q91ZY2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hrh4Q91ZY2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hrh4Q91ZY2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hrh4Q91ZY2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hrh4Q91ZY2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hrh4Q91ZY2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hrh4Q91ZY2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hrh4Q91ZY2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Hrh4Q91ZY2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Hrh4Q91ZY2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hrh4Q91ZY2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms