Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y15

Pcdha5, Protocadherin alpha 5, mousemouse

Predictions only

Length 934 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha5Q91Y15 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcdha5Q91Y15 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcdha5Q91Y15 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcdha5Q91Y15 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcdha5Q91Y15 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcdha5Q91Y15 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcdha5Q91Y15 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcdha5Q91Y15 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcdha5Q91Y15 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcdha5Q91Y15 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcdha5Q91Y15 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcdha5Q91Y15 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcdha5Q91Y15 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcdha5Q91Y15 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcdha5Q91Y15 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcdha5Q91Y15 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcdha5Q91Y15 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcdha5Q91Y15 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcdha5Q91Y15 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcdha5Q91Y15 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcdha5Q91Y15 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcdha5Q91Y15 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcdha5Q91Y15 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcdha5Q91Y15 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcdha5Q91Y15 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcdha5Q91Y15 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcdha5Q91Y15 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcdha5Q91Y15 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcdha5Q91Y15 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcdha5Q91Y15 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcdha5Q91Y15 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcdha5Q91Y15 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcdha5Q91Y15 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcdha5Q91Y15 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcdha5Q91Y15 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcdha5Q91Y15 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdha5Q91Y15 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdha5Q91Y15 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdha5Q91Y15 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdha5Q91Y15 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcdha5Q91Y15 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcdha5Q91Y15 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcdha5Q91Y15 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcdha5Q91Y15 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcdha5Q91Y15 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcdha5Q91Y15 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcdha5Q91Y15 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcdha5Q91Y15 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcdha5Q91Y15 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcdha5Q91Y15 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcdha5Q91Y15 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcdha5Q91Y15 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcdha5Q91Y15 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcdha5Q91Y15 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcdha5Q91Y15 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcdha5Q91Y15 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcdha5Q91Y15 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pcdha5Q91Y15 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcdha5Q91Y15 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcdha5Q91Y15 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcdha5Q91Y15 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcdha5Q91Y15 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcdha5Q91Y15 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcdha5Q91Y15 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcdha5Q91Y15 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcdha5Q91Y15 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcdha5Q91Y15 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcdha5Q91Y15 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcdha5Q91Y15 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcdha5Q91Y15 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcdha5Q91Y15 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcdha5Q91Y15 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcdha5Q91Y15 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcdha5Q91Y15 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcdha5Q91Y15 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcdha5Q91Y15 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcdha5Q91Y15 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcdha5Q91Y15 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcdha5Q91Y15 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcdha5Q91Y15 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcdha5Q91Y15 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcdha5Q91Y15 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcdha5Q91Y15 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcdha5Q91Y15 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcdha5Q91Y15 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcdha5Q91Y15 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcdha5Q91Y15 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcdha5Q91Y15 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcdha5Q91Y15 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcdha5Q91Y15 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcdha5Q91Y15 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcdha5Q91Y15 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcdha5Q91Y15 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pcdha5Q91Y15 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pcdha5Q91Y15 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pcdha5Q91Y15 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pcdha5Q91Y15 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pcdha5Q91Y15 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcdha5Q91Y15 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcdha5Q91Y15 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms