Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y14

Pcdha6, Pcdha6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha6Q91Y14 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcdha6Q91Y14 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcdha6Q91Y14 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcdha6Q91Y14 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcdha6Q91Y14 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcdha6Q91Y14 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdha6Q91Y14 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdha6Q91Y14 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdha6Q91Y14 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdha6Q91Y14 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdha6Q91Y14 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdha6Q91Y14 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcdha6Q91Y14 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcdha6Q91Y14 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcdha6Q91Y14 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcdha6Q91Y14 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcdha6Q91Y14 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcdha6Q91Y14 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcdha6Q91Y14 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdha6Q91Y14 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdha6Q91Y14 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdha6Q91Y14 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdha6Q91Y14 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdha6Q91Y14 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdha6Q91Y14 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdha6Q91Y14 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdha6Q91Y14 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdha6Q91Y14 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdha6Q91Y14 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdha6Q91Y14 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdha6Q91Y14 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdha6Q91Y14 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdha6Q91Y14 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdha6Q91Y14 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdha6Q91Y14 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdha6Q91Y14 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdha6Q91Y14 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdha6Q91Y14 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdha6Q91Y14 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdha6Q91Y14 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdha6Q91Y14 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdha6Q91Y14 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdha6Q91Y14 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdha6Q91Y14 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdha6Q91Y14 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdha6Q91Y14 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdha6Q91Y14 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdha6Q91Y14 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdha6Q91Y14 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdha6Q91Y14 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcdha6Q91Y14 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcdha6Q91Y14 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdha6Q91Y14 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdha6Q91Y14 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdha6Q91Y14 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdha6Q91Y14 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdha6Q91Y14 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdha6Q91Y14 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdha6Q91Y14 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdha6Q91Y14 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdha6Q91Y14 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdha6Q91Y14 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdha6Q91Y14 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdha6Q91Y14 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdha6Q91Y14 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdha6Q91Y14 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdha6Q91Y14 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdha6Q91Y14 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdha6Q91Y14 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdha6Q91Y14 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdha6Q91Y14 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdha6Q91Y14 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdha6Q91Y14 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdha6Q91Y14 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdha6Q91Y14 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdha6Q91Y14 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdha6Q91Y14 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdha6Q91Y14 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdha6Q91Y14 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcdha6Q91Y14 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcdha6Q91Y14 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcdha6Q91Y14 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdha6Q91Y14 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdha6Q91Y14 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcdha6Q91Y14 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcdha6Q91Y14 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcdha6Q91Y14 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcdha6Q91Y14 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcdha6Q91Y14 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcdha6Q91Y14 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcdha6Q91Y14 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcdha6Q91Y14 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcdha6Q91Y14 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcdha6Q91Y14 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcdha6Q91Y14 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdha6Q91Y14 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdha6Q91Y14 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdha6Q91Y14 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdha6Q91Y14 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdha6Q91Y14 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms