Protein–RNA interactions for Protein: Q91WA3

Hdac11, Histone deacetylase 11, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac11Q91WA3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdac11Q91WA3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdac11Q91WA3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac11Q91WA3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac11Q91WA3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac11Q91WA3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac11Q91WA3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac11Q91WA3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdac11Q91WA3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdac11Q91WA3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdac11Q91WA3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdac11Q91WA3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdac11Q91WA3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac11Q91WA3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac11Q91WA3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdac11Q91WA3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdac11Q91WA3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdac11Q91WA3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdac11Q91WA3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdac11Q91WA3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac11Q91WA3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac11Q91WA3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac11Q91WA3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac11Q91WA3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac11Q91WA3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac11Q91WA3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac11Q91WA3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac11Q91WA3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hdac11Q91WA3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hdac11Q91WA3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdac11Q91WA3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdac11Q91WA3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdac11Q91WA3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdac11Q91WA3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdac11Q91WA3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdac11Q91WA3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdac11Q91WA3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdac11Q91WA3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac11Q91WA3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac11Q91WA3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac11Q91WA3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac11Q91WA3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac11Q91WA3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac11Q91WA3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac11Q91WA3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac11Q91WA3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac11Q91WA3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac11Q91WA3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac11Q91WA3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac11Q91WA3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hdac11Q91WA3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hdac11Q91WA3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hdac11Q91WA3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hdac11Q91WA3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac11Q91WA3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac11Q91WA3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac11Q91WA3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac11Q91WA3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac11Q91WA3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac11Q91WA3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac11Q91WA3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdac11Q91WA3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdac11Q91WA3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hdac11Q91WA3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hdac11Q91WA3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hdac11Q91WA3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hdac11Q91WA3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hdac11Q91WA3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hdac11Q91WA3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hdac11Q91WA3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hdac11Q91WA3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hdac11Q91WA3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hdac11Q91WA3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hdac11Q91WA3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hdac11Q91WA3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hdac11Q91WA3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hdac11Q91WA3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hdac11Q91WA3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hdac11Q91WA3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hdac11Q91WA3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hdac11Q91WA3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hdac11Q91WA3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Hdac11Q91WA3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdac11Q91WA3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdac11Q91WA3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdac11Q91WA3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdac11Q91WA3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdac11Q91WA3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Hdac11Q91WA3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hdac11Q91WA3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Hdac11Q91WA3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Hdac11Q91WA3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdac11Q91WA3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdac11Q91WA3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdac11Q91WA3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdac11Q91WA3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdac11Q91WA3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdac11Q91WA3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac11Q91WA3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac11Q91WA3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.9 ms