Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3bgrl3Q91VW3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3bgrl3Q91VW3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bgrl3Q91VW3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bgrl3Q91VW3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bgrl3Q91VW3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bgrl3Q91VW3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bgrl3Q91VW3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bgrl3Q91VW3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bgrl3Q91VW3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bgrl3Q91VW3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bgrl3Q91VW3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bgrl3Q91VW3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bgrl3Q91VW3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bgrl3Q91VW3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bgrl3Q91VW3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bgrl3Q91VW3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bgrl3Q91VW3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bgrl3Q91VW3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bgrl3Q91VW3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bgrl3Q91VW3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bgrl3Q91VW3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bgrl3Q91VW3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bgrl3Q91VW3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3bgrl3Q91VW3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bgrl3Q91VW3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bgrl3Q91VW3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms