Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB2

Alg12, Dol-P-Man:Man(7)GlcNAc(2)-PP-Dol alpha-1,6-mannosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alg12Q8VDB2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Alg12Q8VDB2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Alg12Q8VDB2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Alg12Q8VDB2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Alg12Q8VDB2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Alg12Q8VDB2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Alg12Q8VDB2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Alg12Q8VDB2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Alg12Q8VDB2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Alg12Q8VDB2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Alg12Q8VDB2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Alg12Q8VDB2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Alg12Q8VDB2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Alg12Q8VDB2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
Alg12Q8VDB2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Alg12Q8VDB2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Alg12Q8VDB2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Alg12Q8VDB2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Alg12Q8VDB2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Alg12Q8VDB2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Alg12Q8VDB2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Alg12Q8VDB2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Alg12Q8VDB2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Alg12Q8VDB2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Alg12Q8VDB2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Alg12Q8VDB2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Alg12Q8VDB2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Alg12Q8VDB2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Alg12Q8VDB2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Alg12Q8VDB2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Alg12Q8VDB2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Alg12Q8VDB2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Alg12Q8VDB2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Alg12Q8VDB2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Alg12Q8VDB2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Alg12Q8VDB2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Alg12Q8VDB2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Alg12Q8VDB2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Alg12Q8VDB2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Alg12Q8VDB2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Alg12Q8VDB2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Alg12Q8VDB2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Alg12Q8VDB2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Alg12Q8VDB2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Alg12Q8VDB2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Alg12Q8VDB2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Alg12Q8VDB2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Alg12Q8VDB2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Alg12Q8VDB2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Alg12Q8VDB2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Alg12Q8VDB2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Alg12Q8VDB2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Alg12Q8VDB2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Alg12Q8VDB2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Alg12Q8VDB2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Alg12Q8VDB2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Alg12Q8VDB2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Alg12Q8VDB2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Alg12Q8VDB2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Alg12Q8VDB2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Alg12Q8VDB2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Alg12Q8VDB2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Alg12Q8VDB2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Alg12Q8VDB2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Alg12Q8VDB2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Alg12Q8VDB2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Alg12Q8VDB2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Alg12Q8VDB2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Alg12Q8VDB2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Alg12Q8VDB2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Alg12Q8VDB2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Alg12Q8VDB2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Alg12Q8VDB2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Alg12Q8VDB2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Alg12Q8VDB2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Alg12Q8VDB2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Alg12Q8VDB2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Alg12Q8VDB2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Alg12Q8VDB2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Alg12Q8VDB2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Alg12Q8VDB2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Alg12Q8VDB2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Alg12Q8VDB2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Alg12Q8VDB2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Alg12Q8VDB2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Alg12Q8VDB2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Alg12Q8VDB2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Alg12Q8VDB2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Alg12Q8VDB2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Alg12Q8VDB2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Alg12Q8VDB2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Alg12Q8VDB2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Alg12Q8VDB2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Alg12Q8VDB2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Alg12Q8VDB2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Alg12Q8VDB2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Alg12Q8VDB2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Alg12Q8VDB2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Alg12Q8VDB2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Alg12Q8VDB2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms