Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCK3

Tubg2, Tubulin gamma-2 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg2Q8VCK3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubg2Q8VCK3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubg2Q8VCK3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubg2Q8VCK3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubg2Q8VCK3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubg2Q8VCK3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubg2Q8VCK3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubg2Q8VCK3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubg2Q8VCK3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubg2Q8VCK3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubg2Q8VCK3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubg2Q8VCK3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubg2Q8VCK3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tubg2Q8VCK3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubg2Q8VCK3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubg2Q8VCK3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubg2Q8VCK3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubg2Q8VCK3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubg2Q8VCK3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubg2Q8VCK3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubg2Q8VCK3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubg2Q8VCK3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubg2Q8VCK3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubg2Q8VCK3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubg2Q8VCK3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubg2Q8VCK3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubg2Q8VCK3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubg2Q8VCK3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubg2Q8VCK3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubg2Q8VCK3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubg2Q8VCK3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubg2Q8VCK3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubg2Q8VCK3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubg2Q8VCK3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tubg2Q8VCK3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubg2Q8VCK3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubg2Q8VCK3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubg2Q8VCK3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubg2Q8VCK3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubg2Q8VCK3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubg2Q8VCK3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubg2Q8VCK3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubg2Q8VCK3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubg2Q8VCK3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubg2Q8VCK3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubg2Q8VCK3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubg2Q8VCK3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubg2Q8VCK3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubg2Q8VCK3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubg2Q8VCK3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubg2Q8VCK3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubg2Q8VCK3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tubg2Q8VCK3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tubg2Q8VCK3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tubg2Q8VCK3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubg2Q8VCK3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubg2Q8VCK3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubg2Q8VCK3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubg2Q8VCK3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubg2Q8VCK3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubg2Q8VCK3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubg2Q8VCK3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubg2Q8VCK3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubg2Q8VCK3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubg2Q8VCK3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubg2Q8VCK3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubg2Q8VCK3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubg2Q8VCK3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubg2Q8VCK3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubg2Q8VCK3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubg2Q8VCK3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubg2Q8VCK3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubg2Q8VCK3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tubg2Q8VCK3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tubg2Q8VCK3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tubg2Q8VCK3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tubg2Q8VCK3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tubg2Q8VCK3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tubg2Q8VCK3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tubg2Q8VCK3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tubg2Q8VCK3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubg2Q8VCK3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubg2Q8VCK3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubg2Q8VCK3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubg2Q8VCK3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubg2Q8VCK3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubg2Q8VCK3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubg2Q8VCK3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubg2Q8VCK3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubg2Q8VCK3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tubg2Q8VCK3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tubg2Q8VCK3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubg2Q8VCK3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tubg2Q8VCK3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tubg2Q8VCK3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tubg2Q8VCK3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tubg2Q8VCK3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tubg2Q8VCK3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubg2Q8VCK3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tubg2Q8VCK3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms