Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3C0

Mcmbp, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
McmbpQ8R3C0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
McmbpQ8R3C0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
McmbpQ8R3C0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
McmbpQ8R3C0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
McmbpQ8R3C0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
McmbpQ8R3C0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
McmbpQ8R3C0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
McmbpQ8R3C0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
McmbpQ8R3C0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
McmbpQ8R3C0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
McmbpQ8R3C0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
McmbpQ8R3C0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
McmbpQ8R3C0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
McmbpQ8R3C0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
McmbpQ8R3C0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
McmbpQ8R3C0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
McmbpQ8R3C0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
McmbpQ8R3C0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
McmbpQ8R3C0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
McmbpQ8R3C0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
McmbpQ8R3C0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
McmbpQ8R3C0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
McmbpQ8R3C0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
McmbpQ8R3C0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
McmbpQ8R3C0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
McmbpQ8R3C0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
McmbpQ8R3C0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
McmbpQ8R3C0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
McmbpQ8R3C0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
McmbpQ8R3C0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
McmbpQ8R3C0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
McmbpQ8R3C0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
McmbpQ8R3C0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
McmbpQ8R3C0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
McmbpQ8R3C0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
McmbpQ8R3C0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
McmbpQ8R3C0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
McmbpQ8R3C0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
McmbpQ8R3C0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
McmbpQ8R3C0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
McmbpQ8R3C0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
McmbpQ8R3C0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
McmbpQ8R3C0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
McmbpQ8R3C0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
McmbpQ8R3C0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
McmbpQ8R3C0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
McmbpQ8R3C0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
McmbpQ8R3C0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
McmbpQ8R3C0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
McmbpQ8R3C0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
McmbpQ8R3C0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
McmbpQ8R3C0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
McmbpQ8R3C0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
McmbpQ8R3C0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
McmbpQ8R3C0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
McmbpQ8R3C0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
McmbpQ8R3C0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
McmbpQ8R3C0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
McmbpQ8R3C0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
McmbpQ8R3C0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
McmbpQ8R3C0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
McmbpQ8R3C0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
McmbpQ8R3C0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
McmbpQ8R3C0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
McmbpQ8R3C0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
McmbpQ8R3C0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
McmbpQ8R3C0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
McmbpQ8R3C0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
McmbpQ8R3C0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
McmbpQ8R3C0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
McmbpQ8R3C0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
McmbpQ8R3C0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
McmbpQ8R3C0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
McmbpQ8R3C0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
McmbpQ8R3C0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
McmbpQ8R3C0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
McmbpQ8R3C0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
McmbpQ8R3C0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
McmbpQ8R3C0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
McmbpQ8R3C0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
McmbpQ8R3C0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
McmbpQ8R3C0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
McmbpQ8R3C0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
McmbpQ8R3C0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
McmbpQ8R3C0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
McmbpQ8R3C0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
McmbpQ8R3C0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
McmbpQ8R3C0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
McmbpQ8R3C0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
McmbpQ8R3C0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
McmbpQ8R3C0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
McmbpQ8R3C0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
McmbpQ8R3C0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
McmbpQ8R3C0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
McmbpQ8R3C0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
McmbpQ8R3C0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
McmbpQ8R3C0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
McmbpQ8R3C0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
McmbpQ8R3C0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
McmbpQ8R3C0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms