Protein–RNA interactions for Protein: Q8R284

Vmn1r84, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r84Q8R284 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn1r84Q8R284 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn1r84Q8R284 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn1r84Q8R284 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn1r84Q8R284 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Vmn1r84Q8R284 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vmn1r84Q8R284 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vmn1r84Q8R284 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vmn1r84Q8R284 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn1r84Q8R284 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn1r84Q8R284 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn1r84Q8R284 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn1r84Q8R284 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn1r84Q8R284 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn1r84Q8R284 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vmn1r84Q8R284 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn1r84Q8R284 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vmn1r84Q8R284 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vmn1r84Q8R284 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vmn1r84Q8R284 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vmn1r84Q8R284 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vmn1r84Q8R284 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn1r84Q8R284 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn1r84Q8R284 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn1r84Q8R284 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn1r84Q8R284 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn1r84Q8R284 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn1r84Q8R284 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn1r84Q8R284 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn1r84Q8R284 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn1r84Q8R284 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn1r84Q8R284 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn1r84Q8R284 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn1r84Q8R284 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn1r84Q8R284 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn1r84Q8R284 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn1r84Q8R284 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn1r84Q8R284 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn1r84Q8R284 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn1r84Q8R284 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn1r84Q8R284 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn1r84Q8R284 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn1r84Q8R284 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn1r84Q8R284 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn1r84Q8R284 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn1r84Q8R284 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn1r84Q8R284 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn1r84Q8R284 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vmn1r84Q8R284 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn1r84Q8R284 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn1r84Q8R284 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn1r84Q8R284 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn1r84Q8R284 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn1r84Q8R284 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn1r84Q8R284 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn1r84Q8R284 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn1r84Q8R284 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn1r84Q8R284 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn1r84Q8R284 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn1r84Q8R284 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn1r84Q8R284 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn1r84Q8R284 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn1r84Q8R284 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn1r84Q8R284 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn1r84Q8R284 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn1r84Q8R284 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn1r84Q8R284 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn1r84Q8R284 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn1r84Q8R284 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn1r84Q8R284 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn1r84Q8R284 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn1r84Q8R284 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn1r84Q8R284 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn1r84Q8R284 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn1r84Q8R284 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn1r84Q8R284 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn1r84Q8R284 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn1r84Q8R284 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn1r84Q8R284 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn1r84Q8R284 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn1r84Q8R284 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn1r84Q8R284 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r84Q8R284 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r84Q8R284 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r84Q8R284 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r84Q8R284 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r84Q8R284 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r84Q8R284 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn1r84Q8R284 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn1r84Q8R284 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn1r84Q8R284 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn1r84Q8R284 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn1r84Q8R284 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r84Q8R284 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn1r84Q8R284 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn1r84Q8R284 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn1r84Q8R284 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn1r84Q8R284 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn1r84Q8R284 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn1r84Q8R284 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.4 ms