Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casc3Q8K3W3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casc3Q8K3W3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casc3Q8K3W3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casc3Q8K3W3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casc3Q8K3W3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Casc3Q8K3W3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Casc3Q8K3W3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Casc3Q8K3W3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Casc3Q8K3W3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casc3Q8K3W3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casc3Q8K3W3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casc3Q8K3W3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casc3Q8K3W3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casc3Q8K3W3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Casc3Q8K3W3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Casc3Q8K3W3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Casc3Q8K3W3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Casc3Q8K3W3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Casc3Q8K3W3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casc3Q8K3W3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casc3Q8K3W3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casc3Q8K3W3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casc3Q8K3W3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casc3Q8K3W3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casc3Q8K3W3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casc3Q8K3W3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Casc3Q8K3W3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Casc3Q8K3W3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Casc3Q8K3W3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Casc3Q8K3W3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Casc3Q8K3W3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Casc3Q8K3W3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Casc3Q8K3W3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Casc3Q8K3W3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Casc3Q8K3W3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Casc3Q8K3W3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Casc3Q8K3W3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Casc3Q8K3W3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Casc3Q8K3W3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Casc3Q8K3W3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casc3Q8K3W3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casc3Q8K3W3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Casc3Q8K3W3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Casc3Q8K3W3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Casc3Q8K3W3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Casc3Q8K3W3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Casc3Q8K3W3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Casc3Q8K3W3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Casc3Q8K3W3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Casc3Q8K3W3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Casc3Q8K3W3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Casc3Q8K3W3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Casc3Q8K3W3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Casc3Q8K3W3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Casc3Q8K3W3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Casc3Q8K3W3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Casc3Q8K3W3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Casc3Q8K3W3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Casc3Q8K3W3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Casc3Q8K3W3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Casc3Q8K3W3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Casc3Q8K3W3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Casc3Q8K3W3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Casc3Q8K3W3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Casc3Q8K3W3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Casc3Q8K3W3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Casc3Q8K3W3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Casc3Q8K3W3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Casc3Q8K3W3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Casc3Q8K3W3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Casc3Q8K3W3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Casc3Q8K3W3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Casc3Q8K3W3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Casc3Q8K3W3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Casc3Q8K3W3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Casc3Q8K3W3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Casc3Q8K3W3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Casc3Q8K3W3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Casc3Q8K3W3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Casc3Q8K3W3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Casc3Q8K3W3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Casc3Q8K3W3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Casc3Q8K3W3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Casc3Q8K3W3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Casc3Q8K3W3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Casc3Q8K3W3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Casc3Q8K3W3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Casc3Q8K3W3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Casc3Q8K3W3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Casc3Q8K3W3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Casc3Q8K3W3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Casc3Q8K3W3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Casc3Q8K3W3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Casc3Q8K3W3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Casc3Q8K3W3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Casc3Q8K3W3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casc3Q8K3W3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casc3Q8K3W3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casc3Q8K3W3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms