Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3P5

Cnot6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot6Q8K3P5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnot6Q8K3P5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnot6Q8K3P5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnot6Q8K3P5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnot6Q8K3P5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnot6Q8K3P5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnot6Q8K3P5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnot6Q8K3P5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnot6Q8K3P5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnot6Q8K3P5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cnot6Q8K3P5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cnot6Q8K3P5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cnot6Q8K3P5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cnot6Q8K3P5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cnot6Q8K3P5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cnot6Q8K3P5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cnot6Q8K3P5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cnot6Q8K3P5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cnot6Q8K3P5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cnot6Q8K3P5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cnot6Q8K3P5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cnot6Q8K3P5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cnot6Q8K3P5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Cnot6Q8K3P5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cnot6Q8K3P5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cnot6Q8K3P5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cnot6Q8K3P5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cnot6Q8K3P5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cnot6Q8K3P5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cnot6Q8K3P5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cnot6Q8K3P5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cnot6Q8K3P5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cnot6Q8K3P5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cnot6Q8K3P5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cnot6Q8K3P5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cnot6Q8K3P5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cnot6Q8K3P5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cnot6Q8K3P5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cnot6Q8K3P5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cnot6Q8K3P5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cnot6Q8K3P5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnot6Q8K3P5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnot6Q8K3P5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnot6Q8K3P5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnot6Q8K3P5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnot6Q8K3P5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnot6Q8K3P5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnot6Q8K3P5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnot6Q8K3P5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnot6Q8K3P5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnot6Q8K3P5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnot6Q8K3P5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnot6Q8K3P5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnot6Q8K3P5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnot6Q8K3P5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnot6Q8K3P5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnot6Q8K3P5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnot6Q8K3P5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnot6Q8K3P5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnot6Q8K3P5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnot6Q8K3P5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnot6Q8K3P5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnot6Q8K3P5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnot6Q8K3P5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnot6Q8K3P5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnot6Q8K3P5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnot6Q8K3P5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnot6Q8K3P5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnot6Q8K3P5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnot6Q8K3P5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnot6Q8K3P5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnot6Q8K3P5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnot6Q8K3P5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnot6Q8K3P5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnot6Q8K3P5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnot6Q8K3P5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnot6Q8K3P5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnot6Q8K3P5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnot6Q8K3P5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnot6Q8K3P5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnot6Q8K3P5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnot6Q8K3P5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnot6Q8K3P5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnot6Q8K3P5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnot6Q8K3P5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnot6Q8K3P5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnot6Q8K3P5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnot6Q8K3P5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cnot6Q8K3P5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnot6Q8K3P5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnot6Q8K3P5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnot6Q8K3P5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnot6Q8K3P5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnot6Q8K3P5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnot6Q8K3P5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnot6Q8K3P5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnot6Q8K3P5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cnot6Q8K3P5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cnot6Q8K3P5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cnot6Q8K3P5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms