Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Brd3Q8K2F0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Brd3Q8K2F0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Brd3Q8K2F0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Brd3Q8K2F0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Brd3Q8K2F0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Brd3Q8K2F0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Brd3Q8K2F0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Brd3Q8K2F0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Brd3Q8K2F0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Brd3Q8K2F0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Brd3Q8K2F0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Brd3Q8K2F0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Brd3Q8K2F0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Brd3Q8K2F0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Brd3Q8K2F0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Brd3Q8K2F0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Brd3Q8K2F0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Brd3Q8K2F0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Brd3Q8K2F0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Brd3Q8K2F0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Brd3Q8K2F0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Brd3Q8K2F0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Brd3Q8K2F0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Brd3Q8K2F0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Brd3Q8K2F0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Brd3Q8K2F0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Brd3Q8K2F0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Brd3Q8K2F0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Brd3Q8K2F0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Brd3Q8K2F0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Brd3Q8K2F0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Brd3Q8K2F0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Brd3Q8K2F0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Brd3Q8K2F0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Brd3Q8K2F0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Brd3Q8K2F0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Brd3Q8K2F0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Brd3Q8K2F0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Brd3Q8K2F0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Brd3Q8K2F0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Brd3Q8K2F0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Brd3Q8K2F0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Brd3Q8K2F0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Brd3Q8K2F0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Brd3Q8K2F0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Brd3Q8K2F0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Brd3Q8K2F0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Brd3Q8K2F0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Brd3Q8K2F0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Brd3Q8K2F0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Brd3Q8K2F0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Brd3Q8K2F0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Brd3Q8K2F0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Brd3Q8K2F0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Brd3Q8K2F0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Brd3Q8K2F0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Brd3Q8K2F0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Brd3Q8K2F0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Brd3Q8K2F0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Brd3Q8K2F0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Brd3Q8K2F0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Brd3Q8K2F0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Brd3Q8K2F0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Brd3Q8K2F0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Brd3Q8K2F0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Brd3Q8K2F0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Brd3Q8K2F0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Brd3Q8K2F0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Brd3Q8K2F0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Brd3Q8K2F0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Brd3Q8K2F0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Brd3Q8K2F0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Brd3Q8K2F0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Brd3Q8K2F0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Brd3Q8K2F0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Brd3Q8K2F0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Brd3Q8K2F0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Brd3Q8K2F0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Brd3Q8K2F0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Brd3Q8K2F0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Brd3Q8K2F0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Brd3Q8K2F0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Brd3Q8K2F0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Brd3Q8K2F0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Brd3Q8K2F0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Brd3Q8K2F0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Brd3Q8K2F0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Brd3Q8K2F0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Brd3Q8K2F0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Brd3Q8K2F0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Brd3Q8K2F0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Brd3Q8K2F0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Brd3Q8K2F0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Brd3Q8K2F0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Brd3Q8K2F0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Brd3Q8K2F0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Brd3Q8K2F0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Brd3Q8K2F0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Brd3Q8K2F0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms