Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Mtmr3Q8K296 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Mtmr3Q8K296 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Mtmr3Q8K296 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Mtmr3Q8K296 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Mtmr3Q8K296 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Mtmr3Q8K296 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Mtmr3Q8K296 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Mtmr3Q8K296 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Mtmr3Q8K296 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Mtmr3Q8K296 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Mtmr3Q8K296 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Mtmr3Q8K296 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Mtmr3Q8K296 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Mtmr3Q8K296 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Mtmr3Q8K296 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Mtmr3Q8K296 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Mtmr3Q8K296 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Mtmr3Q8K296 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Mtmr3Q8K296 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Mtmr3Q8K296 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Mtmr3Q8K296 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Mtmr3Q8K296 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Mtmr3Q8K296 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Mtmr3Q8K296 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Mtmr3Q8K296 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Mtmr3Q8K296 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Mtmr3Q8K296 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Mtmr3Q8K296 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Mtmr3Q8K296 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Mtmr3Q8K296 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Mtmr3Q8K296 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Mtmr3Q8K296 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Mtmr3Q8K296 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Mtmr3Q8K296 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Mtmr3Q8K296 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Mtmr3Q8K296 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Mtmr3Q8K296 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Mtmr3Q8K296 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Mtmr3Q8K296 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Mtmr3Q8K296 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Mtmr3Q8K296 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Mtmr3Q8K296 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Mtmr3Q8K296 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Mtmr3Q8K296 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Mtmr3Q8K296 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mtmr3Q8K296 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mtmr3Q8K296 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mtmr3Q8K296 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Mtmr3Q8K296 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Mtmr3Q8K296 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Mtmr3Q8K296 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Mtmr3Q8K296 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Mtmr3Q8K296 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Mtmr3Q8K296 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Mtmr3Q8K296 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Mtmr3Q8K296 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Mtmr3Q8K296 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Mtmr3Q8K296 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Mtmr3Q8K296 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Mtmr3Q8K296 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Mtmr3Q8K296 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Mtmr3Q8K296 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Mtmr3Q8K296 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Mtmr3Q8K296 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Mtmr3Q8K296 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Mtmr3Q8K296 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Mtmr3Q8K296 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Mtmr3Q8K296 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Mtmr3Q8K296 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Mtmr3Q8K296 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Mtmr3Q8K296 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Mtmr3Q8K296 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Mtmr3Q8K296 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Mtmr3Q8K296 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Mtmr3Q8K296 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Mtmr3Q8K296 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Mtmr3Q8K296 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Mtmr3Q8K296 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Mtmr3Q8K296 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Mtmr3Q8K296 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Mtmr3Q8K296 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Mtmr3Q8K296 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Mtmr3Q8K296 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Mtmr3Q8K296 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Mtmr3Q8K296 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Mtmr3Q8K296 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Mtmr3Q8K296 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Mtmr3Q8K296 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Mtmr3Q8K296 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Mtmr3Q8K296 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Mtmr3Q8K296 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Mtmr3Q8K296 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Mtmr3Q8K296 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Mtmr3Q8K296 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Mtmr3Q8K296 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Mtmr3Q8K296 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Mtmr3Q8K296 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Mtmr3Q8K296 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Mtmr3Q8K296 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms