Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1B8

Fermt3, Fermitin family homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fermt3Q8K1B8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fermt3Q8K1B8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fermt3Q8K1B8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fermt3Q8K1B8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fermt3Q8K1B8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fermt3Q8K1B8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fermt3Q8K1B8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fermt3Q8K1B8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fermt3Q8K1B8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fermt3Q8K1B8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fermt3Q8K1B8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fermt3Q8K1B8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fermt3Q8K1B8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fermt3Q8K1B8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fermt3Q8K1B8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fermt3Q8K1B8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fermt3Q8K1B8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fermt3Q8K1B8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fermt3Q8K1B8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Fermt3Q8K1B8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fermt3Q8K1B8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fermt3Q8K1B8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fermt3Q8K1B8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fermt3Q8K1B8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fermt3Q8K1B8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fermt3Q8K1B8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fermt3Q8K1B8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fermt3Q8K1B8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fermt3Q8K1B8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fermt3Q8K1B8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fermt3Q8K1B8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fermt3Q8K1B8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fermt3Q8K1B8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fermt3Q8K1B8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fermt3Q8K1B8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Fermt3Q8K1B8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fermt3Q8K1B8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fermt3Q8K1B8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fermt3Q8K1B8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Fermt3Q8K1B8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fermt3Q8K1B8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fermt3Q8K1B8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fermt3Q8K1B8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fermt3Q8K1B8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fermt3Q8K1B8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fermt3Q8K1B8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fermt3Q8K1B8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fermt3Q8K1B8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Fermt3Q8K1B8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fermt3Q8K1B8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fermt3Q8K1B8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fermt3Q8K1B8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fermt3Q8K1B8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fermt3Q8K1B8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fermt3Q8K1B8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fermt3Q8K1B8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fermt3Q8K1B8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fermt3Q8K1B8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fermt3Q8K1B8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fermt3Q8K1B8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fermt3Q8K1B8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fermt3Q8K1B8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fermt3Q8K1B8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fermt3Q8K1B8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Fermt3Q8K1B8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Fermt3Q8K1B8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fermt3Q8K1B8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fermt3Q8K1B8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fermt3Q8K1B8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Fermt3Q8K1B8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fermt3Q8K1B8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Fermt3Q8K1B8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fermt3Q8K1B8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fermt3Q8K1B8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fermt3Q8K1B8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fermt3Q8K1B8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fermt3Q8K1B8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fermt3Q8K1B8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fermt3Q8K1B8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fermt3Q8K1B8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fermt3Q8K1B8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fermt3Q8K1B8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Fermt3Q8K1B8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fermt3Q8K1B8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fermt3Q8K1B8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fermt3Q8K1B8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fermt3Q8K1B8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fermt3Q8K1B8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fermt3Q8K1B8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fermt3Q8K1B8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fermt3Q8K1B8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fermt3Q8K1B8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fermt3Q8K1B8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fermt3Q8K1B8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fermt3Q8K1B8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fermt3Q8K1B8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fermt3Q8K1B8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fermt3Q8K1B8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fermt3Q8K1B8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fermt3Q8K1B8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.2 ms