Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0V4

Cnot3, CCR4-NOT transcription complex subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot3Q8K0V4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnot3Q8K0V4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnot3Q8K0V4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnot3Q8K0V4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnot3Q8K0V4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnot3Q8K0V4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnot3Q8K0V4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnot3Q8K0V4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cnot3Q8K0V4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Cnot3Q8K0V4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cnot3Q8K0V4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Cnot3Q8K0V4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnot3Q8K0V4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnot3Q8K0V4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnot3Q8K0V4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnot3Q8K0V4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnot3Q8K0V4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnot3Q8K0V4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnot3Q8K0V4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnot3Q8K0V4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnot3Q8K0V4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnot3Q8K0V4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnot3Q8K0V4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnot3Q8K0V4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnot3Q8K0V4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnot3Q8K0V4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnot3Q8K0V4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnot3Q8K0V4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnot3Q8K0V4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnot3Q8K0V4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnot3Q8K0V4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnot3Q8K0V4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnot3Q8K0V4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnot3Q8K0V4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnot3Q8K0V4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnot3Q8K0V4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnot3Q8K0V4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cnot3Q8K0V4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cnot3Q8K0V4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cnot3Q8K0V4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cnot3Q8K0V4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnot3Q8K0V4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnot3Q8K0V4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnot3Q8K0V4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnot3Q8K0V4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnot3Q8K0V4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnot3Q8K0V4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnot3Q8K0V4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnot3Q8K0V4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnot3Q8K0V4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnot3Q8K0V4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnot3Q8K0V4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnot3Q8K0V4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnot3Q8K0V4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnot3Q8K0V4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnot3Q8K0V4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnot3Q8K0V4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnot3Q8K0V4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnot3Q8K0V4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnot3Q8K0V4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnot3Q8K0V4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnot3Q8K0V4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnot3Q8K0V4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnot3Q8K0V4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnot3Q8K0V4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnot3Q8K0V4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnot3Q8K0V4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnot3Q8K0V4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnot3Q8K0V4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnot3Q8K0V4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnot3Q8K0V4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnot3Q8K0V4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cnot3Q8K0V4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cnot3Q8K0V4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cnot3Q8K0V4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cnot3Q8K0V4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnot3Q8K0V4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnot3Q8K0V4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnot3Q8K0V4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnot3Q8K0V4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnot3Q8K0V4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnot3Q8K0V4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnot3Q8K0V4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnot3Q8K0V4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnot3Q8K0V4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnot3Q8K0V4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnot3Q8K0V4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnot3Q8K0V4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnot3Q8K0V4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnot3Q8K0V4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnot3Q8K0V4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnot3Q8K0V4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnot3Q8K0V4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnot3Q8K0V4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnot3Q8K0V4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnot3Q8K0V4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnot3Q8K0V4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnot3Q8K0V4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnot3Q8K0V4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnot3Q8K0V4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.6 ms