Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pkn3Q8K045 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pkn3Q8K045 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pkn3Q8K045 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Pkn3Q8K045 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pkn3Q8K045 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pkn3Q8K045 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pkn3Q8K045 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pkn3Q8K045 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pkn3Q8K045 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pkn3Q8K045 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pkn3Q8K045 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pkn3Q8K045 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pkn3Q8K045 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pkn3Q8K045 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pkn3Q8K045 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Pkn3Q8K045 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pkn3Q8K045 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pkn3Q8K045 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pkn3Q8K045 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pkn3Q8K045 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pkn3Q8K045 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pkn3Q8K045 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pkn3Q8K045 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pkn3Q8K045 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pkn3Q8K045 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pkn3Q8K045 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pkn3Q8K045 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pkn3Q8K045 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pkn3Q8K045 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pkn3Q8K045 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pkn3Q8K045 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Pkn3Q8K045 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pkn3Q8K045 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pkn3Q8K045 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pkn3Q8K045 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pkn3Q8K045 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pkn3Q8K045 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pkn3Q8K045 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pkn3Q8K045 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pkn3Q8K045 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pkn3Q8K045 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pkn3Q8K045 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pkn3Q8K045 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pkn3Q8K045 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pkn3Q8K045 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pkn3Q8K045 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Pkn3Q8K045 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pkn3Q8K045 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Pkn3Q8K045 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pkn3Q8K045 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pkn3Q8K045 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pkn3Q8K045 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pkn3Q8K045 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pkn3Q8K045 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pkn3Q8K045 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pkn3Q8K045 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pkn3Q8K045 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pkn3Q8K045 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pkn3Q8K045 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pkn3Q8K045 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pkn3Q8K045 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pkn3Q8K045 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Pkn3Q8K045 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pkn3Q8K045 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pkn3Q8K045 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pkn3Q8K045 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pkn3Q8K045 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pkn3Q8K045 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Pkn3Q8K045 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pkn3Q8K045 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pkn3Q8K045 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pkn3Q8K045 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pkn3Q8K045 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pkn3Q8K045 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pkn3Q8K045 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pkn3Q8K045 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pkn3Q8K045 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pkn3Q8K045 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pkn3Q8K045 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pkn3Q8K045 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pkn3Q8K045 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pkn3Q8K045 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pkn3Q8K045 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pkn3Q8K045 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pkn3Q8K045 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pkn3Q8K045 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pkn3Q8K045 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pkn3Q8K045 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pkn3Q8K045 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pkn3Q8K045 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pkn3Q8K045 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pkn3Q8K045 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pkn3Q8K045 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pkn3Q8K045 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pkn3Q8K045 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pkn3Q8K045 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pkn3Q8K045 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pkn3Q8K045 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pkn3Q8K045 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms