Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW5

Sh2d5, SH2 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d5Q8JZW5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sh2d5Q8JZW5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Sh2d5Q8JZW5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sh2d5Q8JZW5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sh2d5Q8JZW5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sh2d5Q8JZW5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sh2d5Q8JZW5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sh2d5Q8JZW5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sh2d5Q8JZW5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sh2d5Q8JZW5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sh2d5Q8JZW5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sh2d5Q8JZW5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sh2d5Q8JZW5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sh2d5Q8JZW5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sh2d5Q8JZW5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sh2d5Q8JZW5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sh2d5Q8JZW5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sh2d5Q8JZW5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sh2d5Q8JZW5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sh2d5Q8JZW5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sh2d5Q8JZW5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sh2d5Q8JZW5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sh2d5Q8JZW5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sh2d5Q8JZW5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sh2d5Q8JZW5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sh2d5Q8JZW5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sh2d5Q8JZW5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sh2d5Q8JZW5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sh2d5Q8JZW5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sh2d5Q8JZW5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sh2d5Q8JZW5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sh2d5Q8JZW5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sh2d5Q8JZW5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sh2d5Q8JZW5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sh2d5Q8JZW5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sh2d5Q8JZW5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Sh2d5Q8JZW5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sh2d5Q8JZW5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sh2d5Q8JZW5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sh2d5Q8JZW5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sh2d5Q8JZW5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sh2d5Q8JZW5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sh2d5Q8JZW5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sh2d5Q8JZW5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sh2d5Q8JZW5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sh2d5Q8JZW5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sh2d5Q8JZW5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sh2d5Q8JZW5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sh2d5Q8JZW5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sh2d5Q8JZW5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sh2d5Q8JZW5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sh2d5Q8JZW5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sh2d5Q8JZW5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sh2d5Q8JZW5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sh2d5Q8JZW5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Sh2d5Q8JZW5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sh2d5Q8JZW5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sh2d5Q8JZW5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sh2d5Q8JZW5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sh2d5Q8JZW5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sh2d5Q8JZW5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sh2d5Q8JZW5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Sh2d5Q8JZW5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sh2d5Q8JZW5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sh2d5Q8JZW5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sh2d5Q8JZW5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sh2d5Q8JZW5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sh2d5Q8JZW5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sh2d5Q8JZW5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sh2d5Q8JZW5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh2d5Q8JZW5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sh2d5Q8JZW5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sh2d5Q8JZW5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sh2d5Q8JZW5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sh2d5Q8JZW5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Sh2d5Q8JZW5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sh2d5Q8JZW5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sh2d5Q8JZW5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sh2d5Q8JZW5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sh2d5Q8JZW5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sh2d5Q8JZW5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sh2d5Q8JZW5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sh2d5Q8JZW5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sh2d5Q8JZW5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sh2d5Q8JZW5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sh2d5Q8JZW5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sh2d5Q8JZW5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sh2d5Q8JZW5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sh2d5Q8JZW5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sh2d5Q8JZW5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sh2d5Q8JZW5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sh2d5Q8JZW5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sh2d5Q8JZW5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sh2d5Q8JZW5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Sh2d5Q8JZW5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sh2d5Q8JZW5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sh2d5Q8JZW5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sh2d5Q8JZW5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sh2d5Q8JZW5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh2d5Q8JZW5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.2 ms