Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF1

Arhgap29, Rho GTPase-activating protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap29Q8CGF1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Arhgap29Q8CGF1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Arhgap29Q8CGF1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Arhgap29Q8CGF1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Arhgap29Q8CGF1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Arhgap29Q8CGF1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Arhgap29Q8CGF1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Arhgap29Q8CGF1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Arhgap29Q8CGF1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Arhgap29Q8CGF1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Arhgap29Q8CGF1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Arhgap29Q8CGF1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arhgap29Q8CGF1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arhgap29Q8CGF1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arhgap29Q8CGF1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arhgap29Q8CGF1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arhgap29Q8CGF1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arhgap29Q8CGF1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arhgap29Q8CGF1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arhgap29Q8CGF1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arhgap29Q8CGF1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arhgap29Q8CGF1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arhgap29Q8CGF1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arhgap29Q8CGF1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arhgap29Q8CGF1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Arhgap29Q8CGF1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Arhgap29Q8CGF1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Arhgap29Q8CGF1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Arhgap29Q8CGF1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Arhgap29Q8CGF1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Arhgap29Q8CGF1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Arhgap29Q8CGF1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Arhgap29Q8CGF1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Arhgap29Q8CGF1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arhgap29Q8CGF1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arhgap29Q8CGF1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arhgap29Q8CGF1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Arhgap29Q8CGF1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Arhgap29Q8CGF1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Arhgap29Q8CGF1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Arhgap29Q8CGF1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Arhgap29Q8CGF1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Arhgap29Q8CGF1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Arhgap29Q8CGF1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Arhgap29Q8CGF1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Arhgap29Q8CGF1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Arhgap29Q8CGF1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Arhgap29Q8CGF1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Arhgap29Q8CGF1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Arhgap29Q8CGF1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Arhgap29Q8CGF1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Arhgap29Q8CGF1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Arhgap29Q8CGF1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Arhgap29Q8CGF1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Arhgap29Q8CGF1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Arhgap29Q8CGF1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Arhgap29Q8CGF1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Arhgap29Q8CGF1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Arhgap29Q8CGF1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Arhgap29Q8CGF1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Arhgap29Q8CGF1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Arhgap29Q8CGF1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Arhgap29Q8CGF1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Arhgap29Q8CGF1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Arhgap29Q8CGF1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Arhgap29Q8CGF1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Arhgap29Q8CGF1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Arhgap29Q8CGF1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Arhgap29Q8CGF1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Arhgap29Q8CGF1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Arhgap29Q8CGF1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Arhgap29Q8CGF1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Arhgap29Q8CGF1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Arhgap29Q8CGF1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Arhgap29Q8CGF1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Arhgap29Q8CGF1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Arhgap29Q8CGF1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Arhgap29Q8CGF1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Arhgap29Q8CGF1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Arhgap29Q8CGF1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Arhgap29Q8CGF1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Arhgap29Q8CGF1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Arhgap29Q8CGF1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Arhgap29Q8CGF1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Arhgap29Q8CGF1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Arhgap29Q8CGF1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Arhgap29Q8CGF1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Arhgap29Q8CGF1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Arhgap29Q8CGF1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Arhgap29Q8CGF1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Arhgap29Q8CGF1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Arhgap29Q8CGF1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Arhgap29Q8CGF1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Arhgap29Q8CGF1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Arhgap29Q8CGF1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Arhgap29Q8CGF1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Arhgap29Q8CGF1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Arhgap29Q8CGF1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Arhgap29Q8CGF1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Arhgap29Q8CGF1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms