Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGA3

Slc43a2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a2Q8CGA3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc43a2Q8CGA3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc43a2Q8CGA3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc43a2Q8CGA3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc43a2Q8CGA3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc43a2Q8CGA3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc43a2Q8CGA3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc43a2Q8CGA3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc43a2Q8CGA3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc43a2Q8CGA3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc43a2Q8CGA3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc43a2Q8CGA3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc43a2Q8CGA3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc43a2Q8CGA3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc43a2Q8CGA3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc43a2Q8CGA3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc43a2Q8CGA3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc43a2Q8CGA3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc43a2Q8CGA3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc43a2Q8CGA3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc43a2Q8CGA3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc43a2Q8CGA3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slc43a2Q8CGA3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slc43a2Q8CGA3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slc43a2Q8CGA3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc43a2Q8CGA3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc43a2Q8CGA3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc43a2Q8CGA3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc43a2Q8CGA3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc43a2Q8CGA3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc43a2Q8CGA3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc43a2Q8CGA3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc43a2Q8CGA3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc43a2Q8CGA3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc43a2Q8CGA3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc43a2Q8CGA3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc43a2Q8CGA3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc43a2Q8CGA3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc43a2Q8CGA3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc43a2Q8CGA3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc43a2Q8CGA3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc43a2Q8CGA3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc43a2Q8CGA3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc43a2Q8CGA3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc43a2Q8CGA3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc43a2Q8CGA3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc43a2Q8CGA3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc43a2Q8CGA3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc43a2Q8CGA3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc43a2Q8CGA3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc43a2Q8CGA3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc43a2Q8CGA3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc43a2Q8CGA3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc43a2Q8CGA3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc43a2Q8CGA3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc43a2Q8CGA3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc43a2Q8CGA3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc43a2Q8CGA3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc43a2Q8CGA3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc43a2Q8CGA3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc43a2Q8CGA3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc43a2Q8CGA3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc43a2Q8CGA3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc43a2Q8CGA3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc43a2Q8CGA3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc43a2Q8CGA3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc43a2Q8CGA3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc43a2Q8CGA3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc43a2Q8CGA3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc43a2Q8CGA3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc43a2Q8CGA3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc43a2Q8CGA3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc43a2Q8CGA3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc43a2Q8CGA3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc43a2Q8CGA3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc43a2Q8CGA3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc43a2Q8CGA3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc43a2Q8CGA3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc43a2Q8CGA3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc43a2Q8CGA3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc43a2Q8CGA3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc43a2Q8CGA3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc43a2Q8CGA3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc43a2Q8CGA3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc43a2Q8CGA3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc43a2Q8CGA3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc43a2Q8CGA3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc43a2Q8CGA3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc43a2Q8CGA3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc43a2Q8CGA3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc43a2Q8CGA3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc43a2Q8CGA3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc43a2Q8CGA3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc43a2Q8CGA3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc43a2Q8CGA3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc43a2Q8CGA3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc43a2Q8CGA3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc43a2Q8CGA3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc43a2Q8CGA3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc43a2Q8CGA3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms