Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC5

Nkiras1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras1Q8CEC5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkiras1Q8CEC5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkiras1Q8CEC5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkiras1Q8CEC5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkiras1Q8CEC5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nkiras1Q8CEC5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nkiras1Q8CEC5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nkiras1Q8CEC5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nkiras1Q8CEC5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nkiras1Q8CEC5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nkiras1Q8CEC5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkiras1Q8CEC5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkiras1Q8CEC5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkiras1Q8CEC5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nkiras1Q8CEC5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nkiras1Q8CEC5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nkiras1Q8CEC5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nkiras1Q8CEC5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nkiras1Q8CEC5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nkiras1Q8CEC5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nkiras1Q8CEC5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nkiras1Q8CEC5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nkiras1Q8CEC5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nkiras1Q8CEC5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nkiras1Q8CEC5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nkiras1Q8CEC5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nkiras1Q8CEC5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nkiras1Q8CEC5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nkiras1Q8CEC5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nkiras1Q8CEC5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nkiras1Q8CEC5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkiras1Q8CEC5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkiras1Q8CEC5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nkiras1Q8CEC5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nkiras1Q8CEC5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nkiras1Q8CEC5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nkiras1Q8CEC5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nkiras1Q8CEC5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nkiras1Q8CEC5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nkiras1Q8CEC5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nkiras1Q8CEC5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nkiras1Q8CEC5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nkiras1Q8CEC5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nkiras1Q8CEC5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nkiras1Q8CEC5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nkiras1Q8CEC5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkiras1Q8CEC5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkiras1Q8CEC5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkiras1Q8CEC5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nkiras1Q8CEC5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nkiras1Q8CEC5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nkiras1Q8CEC5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nkiras1Q8CEC5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nkiras1Q8CEC5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nkiras1Q8CEC5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nkiras1Q8CEC5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nkiras1Q8CEC5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nkiras1Q8CEC5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nkiras1Q8CEC5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nkiras1Q8CEC5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nkiras1Q8CEC5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Nkiras1Q8CEC5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nkiras1Q8CEC5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nkiras1Q8CEC5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nkiras1Q8CEC5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nkiras1Q8CEC5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkiras1Q8CEC5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkiras1Q8CEC5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkiras1Q8CEC5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkiras1Q8CEC5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkiras1Q8CEC5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkiras1Q8CEC5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkiras1Q8CEC5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkiras1Q8CEC5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkiras1Q8CEC5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkiras1Q8CEC5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkiras1Q8CEC5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkiras1Q8CEC5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkiras1Q8CEC5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkiras1Q8CEC5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkiras1Q8CEC5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkiras1Q8CEC5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nkiras1Q8CEC5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nkiras1Q8CEC5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nkiras1Q8CEC5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nkiras1Q8CEC5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nkiras1Q8CEC5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nkiras1Q8CEC5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nkiras1Q8CEC5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nkiras1Q8CEC5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nkiras1Q8CEC5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nkiras1Q8CEC5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Nkiras1Q8CEC5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Nkiras1Q8CEC5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nkiras1Q8CEC5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nkiras1Q8CEC5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nkiras1Q8CEC5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Nkiras1Q8CEC5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nkiras1Q8CEC5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nkiras1Q8CEC5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms