Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Lrrc9Q8CDN9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Lrrc9Q8CDN9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
Lrrc9Q8CDN9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
Lrrc9Q8CDN9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Lrrc9Q8CDN9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
Lrrc9Q8CDN9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Lrrc9Q8CDN9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Lrrc9Q8CDN9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Lrrc9Q8CDN9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Lrrc9Q8CDN9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Lrrc9Q8CDN9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Lrrc9Q8CDN9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Lrrc9Q8CDN9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Lrrc9Q8CDN9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Lrrc9Q8CDN9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Lrrc9Q8CDN9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Lrrc9Q8CDN9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Lrrc9Q8CDN9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Lrrc9Q8CDN9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Lrrc9Q8CDN9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Lrrc9Q8CDN9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
Lrrc9Q8CDN9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.5
Lrrc9Q8CDN9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC36.88■■■■□ 3.5
Lrrc9Q8CDN9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
Lrrc9Q8CDN9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Lrrc9Q8CDN9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Lrrc9Q8CDN9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
Lrrc9Q8CDN9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Lrrc9Q8CDN9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Lrrc9Q8CDN9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Lrrc9Q8CDN9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Lrrc9Q8CDN9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Lrrc9Q8CDN9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Lrrc9Q8CDN9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Lrrc9Q8CDN9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC36.82■■■■□ 3.48
Lrrc9Q8CDN9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Lrrc9Q8CDN9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Lrrc9Q8CDN9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Lrrc9Q8CDN9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
Lrrc9Q8CDN9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Lrrc9Q8CDN9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Lrrc9Q8CDN9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Lrrc9Q8CDN9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Lrrc9Q8CDN9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Lrrc9Q8CDN9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Lrrc9Q8CDN9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Lrrc9Q8CDN9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Lrrc9Q8CDN9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Lrrc9Q8CDN9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Lrrc9Q8CDN9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
Lrrc9Q8CDN9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Lrrc9Q8CDN9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Lrrc9Q8CDN9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Lrrc9Q8CDN9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Lrrc9Q8CDN9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
Lrrc9Q8CDN9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Lrrc9Q8CDN9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Lrrc9Q8CDN9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
Lrrc9Q8CDN9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Lrrc9Q8CDN9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
Lrrc9Q8CDN9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Lrrc9Q8CDN9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Lrrc9Q8CDN9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Lrrc9Q8CDN9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Lrrc9Q8CDN9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Lrrc9Q8CDN9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Lrrc9Q8CDN9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
Lrrc9Q8CDN9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Lrrc9Q8CDN9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Lrrc9Q8CDN9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
Lrrc9Q8CDN9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Lrrc9Q8CDN9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Lrrc9Q8CDN9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Lrrc9Q8CDN9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Lrrc9Q8CDN9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Lrrc9Q8CDN9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
Lrrc9Q8CDN9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
Lrrc9Q8CDN9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Lrrc9Q8CDN9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
Lrrc9Q8CDN9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Lrrc9Q8CDN9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Lrrc9Q8CDN9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Lrrc9Q8CDN9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Lrrc9Q8CDN9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Lrrc9Q8CDN9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Lrrc9Q8CDN9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Lrrc9Q8CDN9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Lrrc9Q8CDN9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Lrrc9Q8CDN9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Lrrc9Q8CDN9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Lrrc9Q8CDN9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
Lrrc9Q8CDN9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Lrrc9Q8CDN9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Lrrc9Q8CDN9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Lrrc9Q8CDN9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Lrrc9Q8CDN9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Lrrc9Q8CDN9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Lrrc9Q8CDN9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Lrrc9Q8CDN9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms