Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCX5

Krt222, Keratin-like protein KRT222, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt222Q8CCX5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt222Q8CCX5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt222Q8CCX5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt222Q8CCX5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt222Q8CCX5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt222Q8CCX5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt222Q8CCX5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt222Q8CCX5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt222Q8CCX5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt222Q8CCX5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt222Q8CCX5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt222Q8CCX5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt222Q8CCX5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Krt222Q8CCX5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Krt222Q8CCX5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Krt222Q8CCX5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt222Q8CCX5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt222Q8CCX5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt222Q8CCX5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt222Q8CCX5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt222Q8CCX5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt222Q8CCX5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt222Q8CCX5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt222Q8CCX5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt222Q8CCX5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt222Q8CCX5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt222Q8CCX5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt222Q8CCX5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt222Q8CCX5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt222Q8CCX5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt222Q8CCX5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt222Q8CCX5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt222Q8CCX5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt222Q8CCX5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt222Q8CCX5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt222Q8CCX5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt222Q8CCX5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt222Q8CCX5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Krt222Q8CCX5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Krt222Q8CCX5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Krt222Q8CCX5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt222Q8CCX5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt222Q8CCX5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt222Q8CCX5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt222Q8CCX5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt222Q8CCX5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt222Q8CCX5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt222Q8CCX5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt222Q8CCX5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt222Q8CCX5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Krt222Q8CCX5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Krt222Q8CCX5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Krt222Q8CCX5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Krt222Q8CCX5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Krt222Q8CCX5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Krt222Q8CCX5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Krt222Q8CCX5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Krt222Q8CCX5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Krt222Q8CCX5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt222Q8CCX5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt222Q8CCX5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt222Q8CCX5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt222Q8CCX5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt222Q8CCX5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt222Q8CCX5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt222Q8CCX5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt222Q8CCX5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt222Q8CCX5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt222Q8CCX5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt222Q8CCX5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt222Q8CCX5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt222Q8CCX5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt222Q8CCX5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt222Q8CCX5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt222Q8CCX5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt222Q8CCX5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt222Q8CCX5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt222Q8CCX5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt222Q8CCX5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt222Q8CCX5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt222Q8CCX5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt222Q8CCX5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt222Q8CCX5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt222Q8CCX5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt222Q8CCX5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt222Q8CCX5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt222Q8CCX5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt222Q8CCX5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt222Q8CCX5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt222Q8CCX5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt222Q8CCX5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt222Q8CCX5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt222Q8CCX5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt222Q8CCX5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt222Q8CCX5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt222Q8CCX5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt222Q8CCX5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt222Q8CCX5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt222Q8CCX5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt222Q8CCX5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms