Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCT7

Nsun3, tRNA (cytosine(34)-C(5))-methyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsun3Q8CCT7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nsun3Q8CCT7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nsun3Q8CCT7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nsun3Q8CCT7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nsun3Q8CCT7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nsun3Q8CCT7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nsun3Q8CCT7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nsun3Q8CCT7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nsun3Q8CCT7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nsun3Q8CCT7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nsun3Q8CCT7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nsun3Q8CCT7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nsun3Q8CCT7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nsun3Q8CCT7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nsun3Q8CCT7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nsun3Q8CCT7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nsun3Q8CCT7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Nsun3Q8CCT7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nsun3Q8CCT7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nsun3Q8CCT7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nsun3Q8CCT7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nsun3Q8CCT7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nsun3Q8CCT7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nsun3Q8CCT7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nsun3Q8CCT7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nsun3Q8CCT7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nsun3Q8CCT7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nsun3Q8CCT7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nsun3Q8CCT7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nsun3Q8CCT7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nsun3Q8CCT7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nsun3Q8CCT7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nsun3Q8CCT7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nsun3Q8CCT7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nsun3Q8CCT7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nsun3Q8CCT7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nsun3Q8CCT7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nsun3Q8CCT7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nsun3Q8CCT7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nsun3Q8CCT7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nsun3Q8CCT7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nsun3Q8CCT7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Nsun3Q8CCT7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nsun3Q8CCT7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nsun3Q8CCT7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nsun3Q8CCT7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nsun3Q8CCT7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nsun3Q8CCT7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nsun3Q8CCT7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nsun3Q8CCT7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nsun3Q8CCT7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nsun3Q8CCT7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nsun3Q8CCT7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nsun3Q8CCT7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nsun3Q8CCT7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nsun3Q8CCT7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nsun3Q8CCT7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nsun3Q8CCT7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Nsun3Q8CCT7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nsun3Q8CCT7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nsun3Q8CCT7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nsun3Q8CCT7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nsun3Q8CCT7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nsun3Q8CCT7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nsun3Q8CCT7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nsun3Q8CCT7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nsun3Q8CCT7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nsun3Q8CCT7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nsun3Q8CCT7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nsun3Q8CCT7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Nsun3Q8CCT7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nsun3Q8CCT7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nsun3Q8CCT7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nsun3Q8CCT7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nsun3Q8CCT7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nsun3Q8CCT7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nsun3Q8CCT7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nsun3Q8CCT7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nsun3Q8CCT7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Nsun3Q8CCT7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nsun3Q8CCT7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nsun3Q8CCT7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nsun3Q8CCT7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nsun3Q8CCT7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Nsun3Q8CCT7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nsun3Q8CCT7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nsun3Q8CCT7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Nsun3Q8CCT7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Nsun3Q8CCT7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nsun3Q8CCT7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nsun3Q8CCT7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nsun3Q8CCT7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Nsun3Q8CCT7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nsun3Q8CCT7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nsun3Q8CCT7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nsun3Q8CCT7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Nsun3Q8CCT7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nsun3Q8CCT7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nsun3Q8CCT7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nsun3Q8CCT7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms