Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RybpQ8CCI5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RybpQ8CCI5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RybpQ8CCI5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RybpQ8CCI5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RybpQ8CCI5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RybpQ8CCI5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RybpQ8CCI5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RybpQ8CCI5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RybpQ8CCI5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RybpQ8CCI5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RybpQ8CCI5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RybpQ8CCI5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RybpQ8CCI5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RybpQ8CCI5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RybpQ8CCI5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RybpQ8CCI5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RybpQ8CCI5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RybpQ8CCI5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RybpQ8CCI5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RybpQ8CCI5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RybpQ8CCI5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RybpQ8CCI5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RybpQ8CCI5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RybpQ8CCI5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RybpQ8CCI5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RybpQ8CCI5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RybpQ8CCI5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RybpQ8CCI5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RybpQ8CCI5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RybpQ8CCI5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RybpQ8CCI5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RybpQ8CCI5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RybpQ8CCI5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RybpQ8CCI5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RybpQ8CCI5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RybpQ8CCI5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RybpQ8CCI5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RybpQ8CCI5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RybpQ8CCI5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RybpQ8CCI5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RybpQ8CCI5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RybpQ8CCI5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RybpQ8CCI5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RybpQ8CCI5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RybpQ8CCI5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RybpQ8CCI5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RybpQ8CCI5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RybpQ8CCI5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RybpQ8CCI5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RybpQ8CCI5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RybpQ8CCI5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RybpQ8CCI5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RybpQ8CCI5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RybpQ8CCI5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RybpQ8CCI5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RybpQ8CCI5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RybpQ8CCI5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RybpQ8CCI5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RybpQ8CCI5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RybpQ8CCI5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RybpQ8CCI5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RybpQ8CCI5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RybpQ8CCI5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RybpQ8CCI5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RybpQ8CCI5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RybpQ8CCI5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RybpQ8CCI5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RybpQ8CCI5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RybpQ8CCI5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RybpQ8CCI5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RybpQ8CCI5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RybpQ8CCI5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RybpQ8CCI5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RybpQ8CCI5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RybpQ8CCI5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RybpQ8CCI5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RybpQ8CCI5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RybpQ8CCI5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RybpQ8CCI5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RybpQ8CCI5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RybpQ8CCI5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RybpQ8CCI5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RybpQ8CCI5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RybpQ8CCI5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RybpQ8CCI5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RybpQ8CCI5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RybpQ8CCI5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RybpQ8CCI5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RybpQ8CCI5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RybpQ8CCI5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RybpQ8CCI5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RybpQ8CCI5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RybpQ8CCI5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RybpQ8CCI5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RybpQ8CCI5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RybpQ8CCI5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RybpQ8CCI5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RybpQ8CCI5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RybpQ8CCI5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 224.9 ms