Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC96

Uncharacterized protein C6orf222 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CC96 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Q8CC96 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q8CC96 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q8CC96 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q8CC96 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q8CC96 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q8CC96 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q8CC96 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q8CC96 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q8CC96 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q8CC96 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q8CC96 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q8CC96 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q8CC96 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q8CC96 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q8CC96 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q8CC96 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q8CC96 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q8CC96 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q8CC96 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q8CC96 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Q8CC96 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Q8CC96 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Q8CC96 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Q8CC96 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q8CC96 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q8CC96 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q8CC96 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q8CC96 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q8CC96 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q8CC96 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q8CC96 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q8CC96 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Q8CC96 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q8CC96 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Q8CC96 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q8CC96 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q8CC96 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q8CC96 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q8CC96 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q8CC96 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q8CC96 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q8CC96 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q8CC96 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q8CC96 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q8CC96 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Q8CC96 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q8CC96 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q8CC96 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q8CC96 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q8CC96 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q8CC96 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q8CC96 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q8CC96 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q8CC96 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q8CC96 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Q8CC96 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Q8CC96 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q8CC96 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q8CC96 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q8CC96 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q8CC96 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q8CC96 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q8CC96 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q8CC96 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q8CC96 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q8CC96 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q8CC96 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Q8CC96 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q8CC96 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Q8CC96 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q8CC96 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q8CC96 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q8CC96 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q8CC96 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q8CC96 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q8CC96 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q8CC96 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q8CC96 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Q8CC96 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q8CC96 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q8CC96 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q8CC96 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q8CC96 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q8CC96 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q8CC96 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q8CC96 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Q8CC96 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q8CC96 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q8CC96 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Q8CC96 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q8CC96 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q8CC96 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q8CC96 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Q8CC96 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Q8CC96 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q8CC96 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q8CC96 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Q8CC96 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q8CC96 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms