Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ubqln3Q8C5U9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ubqln3Q8C5U9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ubqln3Q8C5U9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ubqln3Q8C5U9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ubqln3Q8C5U9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ubqln3Q8C5U9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ubqln3Q8C5U9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ubqln3Q8C5U9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ubqln3Q8C5U9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ubqln3Q8C5U9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ubqln3Q8C5U9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ubqln3Q8C5U9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ubqln3Q8C5U9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ubqln3Q8C5U9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ubqln3Q8C5U9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubqln3Q8C5U9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubqln3Q8C5U9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ubqln3Q8C5U9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubqln3Q8C5U9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubqln3Q8C5U9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubqln3Q8C5U9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubqln3Q8C5U9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubqln3Q8C5U9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ubqln3Q8C5U9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubqln3Q8C5U9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubqln3Q8C5U9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubqln3Q8C5U9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubqln3Q8C5U9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubqln3Q8C5U9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubqln3Q8C5U9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubqln3Q8C5U9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubqln3Q8C5U9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubqln3Q8C5U9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubqln3Q8C5U9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubqln3Q8C5U9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubqln3Q8C5U9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubqln3Q8C5U9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubqln3Q8C5U9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubqln3Q8C5U9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubqln3Q8C5U9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubqln3Q8C5U9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ubqln3Q8C5U9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ubqln3Q8C5U9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ubqln3Q8C5U9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ubqln3Q8C5U9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ubqln3Q8C5U9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ubqln3Q8C5U9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubqln3Q8C5U9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubqln3Q8C5U9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubqln3Q8C5U9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubqln3Q8C5U9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubqln3Q8C5U9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
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Ubqln3Q8C5U9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubqln3Q8C5U9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ubqln3Q8C5U9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ubqln3Q8C5U9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ubqln3Q8C5U9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ubqln3Q8C5U9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
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Ubqln3Q8C5U9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ubqln3Q8C5U9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ubqln3Q8C5U9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ubqln3Q8C5U9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ubqln3Q8C5U9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ubqln3Q8C5U9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ubqln3Q8C5U9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ubqln3Q8C5U9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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Ubqln3Q8C5U9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ubqln3Q8C5U9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ubqln3Q8C5U9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ubqln3Q8C5U9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ubqln3Q8C5U9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ubqln3Q8C5U9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ubqln3Q8C5U9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ubqln3Q8C5U9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ubqln3Q8C5U9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ubqln3Q8C5U9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ubqln3Q8C5U9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ubqln3Q8C5U9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ubqln3Q8C5U9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ubqln3Q8C5U9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ubqln3Q8C5U9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ubqln3Q8C5U9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ubqln3Q8C5U9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ubqln3Q8C5U9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ubqln3Q8C5U9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ubqln3Q8C5U9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ubqln3Q8C5U9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ubqln3Q8C5U9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubqln3Q8C5U9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubqln3Q8C5U9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubqln3Q8C5U9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubqln3Q8C5U9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubqln3Q8C5U9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubqln3Q8C5U9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubqln3Q8C5U9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubqln3Q8C5U9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
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